Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKE5

TNIK, TRAF2 and NCK-interacting protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 1,360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIKQ9UKE5 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
TNIKQ9UKE5 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
TNIKQ9UKE5 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC39.08■■■■□ 3.85
TNIKQ9UKE5 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC39.08■■■■□ 3.85
TNIKQ9UKE5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
TNIKQ9UKE5 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.08■■■■□ 3.85
TNIKQ9UKE5 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.85
TNIKQ9UKE5 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.85
TNIKQ9UKE5 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC39.07■■■■□ 3.85
TNIKQ9UKE5 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.85
TNIKQ9UKE5 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC39.07■■■■□ 3.84
TNIKQ9UKE5 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC39.07■■■■□ 3.84
TNIKQ9UKE5 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC39.07■■■■□ 3.84
TNIKQ9UKE5 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
TNIKQ9UKE5 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.06■■■■□ 3.84
TNIKQ9UKE5 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC39.06■■■■□ 3.84
TNIKQ9UKE5 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
TNIKQ9UKE5 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.06■■■■□ 3.84
TNIKQ9UKE5 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC39.05■■■■□ 3.84
TNIKQ9UKE5 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC39.05■■■■□ 3.84
TNIKQ9UKE5 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC39.05■■■■□ 3.84
TNIKQ9UKE5 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
TNIKQ9UKE5 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC39.05■■■■□ 3.84
TNIKQ9UKE5 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
TNIKQ9UKE5 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
TNIKQ9UKE5 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC39.04■■■■□ 3.84
TNIKQ9UKE5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
TNIKQ9UKE5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
TNIKQ9UKE5 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
TNIKQ9UKE5 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.02■■■■□ 3.84
TNIKQ9UKE5 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
TNIKQ9UKE5 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC39.01■■■■□ 3.84
TNIKQ9UKE5 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC39.01■■■■□ 3.84
TNIKQ9UKE5 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC39.01■■■■□ 3.84
TNIKQ9UKE5 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC39■■■■□ 3.83
TNIKQ9UKE5 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
TNIKQ9UKE5 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
TNIKQ9UKE5 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
TNIKQ9UKE5 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
TNIKQ9UKE5 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
TNIKQ9UKE5 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC38.99■■■■□ 3.83
TNIKQ9UKE5 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
TNIKQ9UKE5 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC38.99■■■■□ 3.83
TNIKQ9UKE5 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC38.98■■■■□ 3.83
TNIKQ9UKE5 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
TNIKQ9UKE5 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC38.98■■■■□ 3.83
TNIKQ9UKE5 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
TNIKQ9UKE5 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
TNIKQ9UKE5 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC38.97■■■■□ 3.83
TNIKQ9UKE5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
TNIKQ9UKE5 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
TNIKQ9UKE5 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
TNIKQ9UKE5 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
TNIKQ9UKE5 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC38.96■■■■□ 3.83
TNIKQ9UKE5 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC38.95■■■■□ 3.83
TNIKQ9UKE5 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
TNIKQ9UKE5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
TNIKQ9UKE5 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
TNIKQ9UKE5 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC38.95■■■■□ 3.83
TNIKQ9UKE5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
TNIKQ9UKE5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
TNIKQ9UKE5 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
TNIKQ9UKE5 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC38.94■■■■□ 3.82
TNIKQ9UKE5 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
TNIKQ9UKE5 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
TNIKQ9UKE5 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC38.93■■■■□ 3.82
TNIKQ9UKE5 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC38.93■■■■□ 3.82
TNIKQ9UKE5 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC38.92■■■■□ 3.82
TNIKQ9UKE5 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
TNIKQ9UKE5 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC38.92■■■■□ 3.82
TNIKQ9UKE5 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
TNIKQ9UKE5 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
TNIKQ9UKE5 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC38.91■■■■□ 3.82
TNIKQ9UKE5 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC38.9■■■■□ 3.82
TNIKQ9UKE5 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC38.9■■■■□ 3.82
TNIKQ9UKE5 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC38.9■■■■□ 3.82
TNIKQ9UKE5 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC38.9■■■■□ 3.82
TNIKQ9UKE5 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
TNIKQ9UKE5 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC38.89■■■■□ 3.82
TNIKQ9UKE5 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC38.89■■■■□ 3.82
TNIKQ9UKE5 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.82
TNIKQ9UKE5 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.82
TNIKQ9UKE5 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
TNIKQ9UKE5 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
TNIKQ9UKE5 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC38.88■■■■□ 3.81
TNIKQ9UKE5 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
TNIKQ9UKE5 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
TNIKQ9UKE5 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
TNIKQ9UKE5 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
TNIKQ9UKE5 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
TNIKQ9UKE5 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC38.87■■■■□ 3.81
TNIKQ9UKE5 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
TNIKQ9UKE5 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC38.86■■■■□ 3.81
TNIKQ9UKE5 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC38.86■■■■□ 3.81
TNIKQ9UKE5 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC38.86■■■■□ 3.81
TNIKQ9UKE5 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC38.86■■■■□ 3.81
TNIKQ9UKE5 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.86■■■■□ 3.81
TNIKQ9UKE5 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC38.86■■■■□ 3.81
TNIKQ9UKE5 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC38.86■■■■□ 3.81
TNIKQ9UKE5 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms