Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG01

IFT172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT172Q9UG01 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC34.19■■■■□ 3.06
IFT172Q9UG01 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
IFT172Q9UG01 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
IFT172Q9UG01 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
IFT172Q9UG01 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
IFT172Q9UG01 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC34.18■■■■□ 3.06
IFT172Q9UG01 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
IFT172Q9UG01 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
IFT172Q9UG01 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
IFT172Q9UG01 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC34.18■■■■□ 3.06
IFT172Q9UG01 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
IFT172Q9UG01 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
IFT172Q9UG01 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
IFT172Q9UG01 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
IFT172Q9UG01 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
IFT172Q9UG01 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
IFT172Q9UG01 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC34.16■■■■□ 3.06
IFT172Q9UG01 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
IFT172Q9UG01 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
IFT172Q9UG01 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
IFT172Q9UG01 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
IFT172Q9UG01 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
IFT172Q9UG01 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
IFT172Q9UG01 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
IFT172Q9UG01 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
IFT172Q9UG01 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
IFT172Q9UG01 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
IFT172Q9UG01 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
IFT172Q9UG01 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
IFT172Q9UG01 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
IFT172Q9UG01 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC34.13■■■■□ 3.05
IFT172Q9UG01 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
IFT172Q9UG01 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
IFT172Q9UG01 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
IFT172Q9UG01 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
IFT172Q9UG01 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
IFT172Q9UG01 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
IFT172Q9UG01 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
IFT172Q9UG01 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
IFT172Q9UG01 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
IFT172Q9UG01 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC34.1■■■■□ 3.05
IFT172Q9UG01 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
IFT172Q9UG01 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
IFT172Q9UG01 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
IFT172Q9UG01 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
IFT172Q9UG01 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
IFT172Q9UG01 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
IFT172Q9UG01 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.05
IFT172Q9UG01 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.05
IFT172Q9UG01 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
IFT172Q9UG01 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
IFT172Q9UG01 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
IFT172Q9UG01 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
IFT172Q9UG01 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC34.06■■■■□ 3.04
IFT172Q9UG01 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
IFT172Q9UG01 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
IFT172Q9UG01 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
IFT172Q9UG01 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
IFT172Q9UG01 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
IFT172Q9UG01 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
IFT172Q9UG01 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
IFT172Q9UG01 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
IFT172Q9UG01 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
IFT172Q9UG01 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
IFT172Q9UG01 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
IFT172Q9UG01 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
IFT172Q9UG01 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
IFT172Q9UG01 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
IFT172Q9UG01 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
IFT172Q9UG01 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
IFT172Q9UG01 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
IFT172Q9UG01 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
IFT172Q9UG01 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
IFT172Q9UG01 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC34.01■■■■□ 3.04
IFT172Q9UG01 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC34.01■■■■□ 3.04
IFT172Q9UG01 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
IFT172Q9UG01 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
IFT172Q9UG01 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC34.01■■■■□ 3.04
IFT172Q9UG01 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
IFT172Q9UG01 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC34.01■■■■□ 3.03
IFT172Q9UG01 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
IFT172Q9UG01 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
IFT172Q9UG01 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
IFT172Q9UG01 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC34.01■■■■□ 3.03
IFT172Q9UG01 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
IFT172Q9UG01 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
IFT172Q9UG01 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
IFT172Q9UG01 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
IFT172Q9UG01 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
IFT172Q9UG01 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
IFT172Q9UG01 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC33.99■■■■□ 3.03
IFT172Q9UG01 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
IFT172Q9UG01 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
IFT172Q9UG01 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
IFT172Q9UG01 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
IFT172Q9UG01 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
IFT172Q9UG01 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
IFT172Q9UG01 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC33.97■■■■□ 3.03
IFT172Q9UG01 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
IFT172Q9UG01 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.3 ms