Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CGGBP1Q9UFW8 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CGGBP1Q9UFW8 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CGGBP1Q9UFW8 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CGGBP1Q9UFW8 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CGGBP1Q9UFW8 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CGGBP1Q9UFW8 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CGGBP1Q9UFW8 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CGGBP1Q9UFW8 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CGGBP1Q9UFW8 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CGGBP1Q9UFW8 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CGGBP1Q9UFW8 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CGGBP1Q9UFW8 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CGGBP1Q9UFW8 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CGGBP1Q9UFW8 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CGGBP1Q9UFW8 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CGGBP1Q9UFW8 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CGGBP1Q9UFW8 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CGGBP1Q9UFW8 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CGGBP1Q9UFW8 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CGGBP1Q9UFW8 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CGGBP1Q9UFW8 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CGGBP1Q9UFW8 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CGGBP1Q9UFW8 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CGGBP1Q9UFW8 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CGGBP1Q9UFW8 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CGGBP1Q9UFW8 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CGGBP1Q9UFW8 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CGGBP1Q9UFW8 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CGGBP1Q9UFW8 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CGGBP1Q9UFW8 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CGGBP1Q9UFW8 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CGGBP1Q9UFW8 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CGGBP1Q9UFW8 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CGGBP1Q9UFW8 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CGGBP1Q9UFW8 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CGGBP1Q9UFW8 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CGGBP1Q9UFW8 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CGGBP1Q9UFW8 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CGGBP1Q9UFW8 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CGGBP1Q9UFW8 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CGGBP1Q9UFW8 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CGGBP1Q9UFW8 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CGGBP1Q9UFW8 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CGGBP1Q9UFW8 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CGGBP1Q9UFW8 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CGGBP1Q9UFW8 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CGGBP1Q9UFW8 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CGGBP1Q9UFW8 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CGGBP1Q9UFW8 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CGGBP1Q9UFW8 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CGGBP1Q9UFW8 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CGGBP1Q9UFW8 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CGGBP1Q9UFW8 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CGGBP1Q9UFW8 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CGGBP1Q9UFW8 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CGGBP1Q9UFW8 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CGGBP1Q9UFW8 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CGGBP1Q9UFW8 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
CGGBP1Q9UFW8 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CGGBP1Q9UFW8 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CGGBP1Q9UFW8 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CGGBP1Q9UFW8 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CGGBP1Q9UFW8 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CGGBP1Q9UFW8 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CGGBP1Q9UFW8 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CGGBP1Q9UFW8 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CGGBP1Q9UFW8 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CGGBP1Q9UFW8 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CGGBP1Q9UFW8 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CGGBP1Q9UFW8 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CGGBP1Q9UFW8 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CGGBP1Q9UFW8 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CGGBP1Q9UFW8 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CGGBP1Q9UFW8 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CGGBP1Q9UFW8 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CGGBP1Q9UFW8 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CGGBP1Q9UFW8 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CGGBP1Q9UFW8 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CGGBP1Q9UFW8 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CGGBP1Q9UFW8 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CGGBP1Q9UFW8 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CGGBP1Q9UFW8 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CGGBP1Q9UFW8 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CGGBP1Q9UFW8 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CGGBP1Q9UFW8 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CGGBP1Q9UFW8 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CGGBP1Q9UFW8 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CGGBP1Q9UFW8 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CGGBP1Q9UFW8 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CGGBP1Q9UFW8 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CGGBP1Q9UFW8 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
CGGBP1Q9UFW8 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CGGBP1Q9UFW8 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CGGBP1Q9UFW8 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CGGBP1Q9UFW8 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CGGBP1Q9UFW8 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CGGBP1Q9UFW8 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CGGBP1Q9UFW8 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CGGBP1Q9UFW8 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
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