Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR8

RDH8, Retinol dehydrogenase 8, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH8Q9NYR8 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RDH8Q9NYR8 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RDH8Q9NYR8 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RDH8Q9NYR8 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RDH8Q9NYR8 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RDH8Q9NYR8 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RDH8Q9NYR8 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RDH8Q9NYR8 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RDH8Q9NYR8 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RDH8Q9NYR8 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RDH8Q9NYR8 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RDH8Q9NYR8 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RDH8Q9NYR8 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RDH8Q9NYR8 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RDH8Q9NYR8 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RDH8Q9NYR8 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RDH8Q9NYR8 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RDH8Q9NYR8 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RDH8Q9NYR8 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RDH8Q9NYR8 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RDH8Q9NYR8 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
RDH8Q9NYR8 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
RDH8Q9NYR8 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
RDH8Q9NYR8 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RDH8Q9NYR8 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RDH8Q9NYR8 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
RDH8Q9NYR8 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RDH8Q9NYR8 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RDH8Q9NYR8 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RDH8Q9NYR8 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RDH8Q9NYR8 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RDH8Q9NYR8 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RDH8Q9NYR8 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RDH8Q9NYR8 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
RDH8Q9NYR8 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RDH8Q9NYR8 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RDH8Q9NYR8 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
RDH8Q9NYR8 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RDH8Q9NYR8 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RDH8Q9NYR8 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RDH8Q9NYR8 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RDH8Q9NYR8 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RDH8Q9NYR8 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RDH8Q9NYR8 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RDH8Q9NYR8 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RDH8Q9NYR8 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RDH8Q9NYR8 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RDH8Q9NYR8 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RDH8Q9NYR8 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RDH8Q9NYR8 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RDH8Q9NYR8 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RDH8Q9NYR8 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RDH8Q9NYR8 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
RDH8Q9NYR8 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RDH8Q9NYR8 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RDH8Q9NYR8 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RDH8Q9NYR8 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RDH8Q9NYR8 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RDH8Q9NYR8 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RDH8Q9NYR8 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RDH8Q9NYR8 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RDH8Q9NYR8 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RDH8Q9NYR8 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RDH8Q9NYR8 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RDH8Q9NYR8 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RDH8Q9NYR8 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RDH8Q9NYR8 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RDH8Q9NYR8 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RDH8Q9NYR8 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RDH8Q9NYR8 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RDH8Q9NYR8 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RDH8Q9NYR8 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RDH8Q9NYR8 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RDH8Q9NYR8 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RDH8Q9NYR8 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
RDH8Q9NYR8 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RDH8Q9NYR8 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RDH8Q9NYR8 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RDH8Q9NYR8 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RDH8Q9NYR8 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
RDH8Q9NYR8 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RDH8Q9NYR8 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RDH8Q9NYR8 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RDH8Q9NYR8 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RDH8Q9NYR8 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RDH8Q9NYR8 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RDH8Q9NYR8 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RDH8Q9NYR8 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RDH8Q9NYR8 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RDH8Q9NYR8 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RDH8Q9NYR8 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RDH8Q9NYR8 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RDH8Q9NYR8 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RDH8Q9NYR8 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RDH8Q9NYR8 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RDH8Q9NYR8 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RDH8Q9NYR8 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RDH8Q9NYR8 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RDH8Q9NYR8 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RDH8Q9NYR8 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms