Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYI0

PSD3, PH and SEC7 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSD3Q9NYI0 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PSD3Q9NYI0 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PSD3Q9NYI0 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PSD3Q9NYI0 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PSD3Q9NYI0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PSD3Q9NYI0 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PSD3Q9NYI0 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PSD3Q9NYI0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PSD3Q9NYI0 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PSD3Q9NYI0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PSD3Q9NYI0 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PSD3Q9NYI0 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PSD3Q9NYI0 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PSD3Q9NYI0 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PSD3Q9NYI0 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PSD3Q9NYI0 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PSD3Q9NYI0 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PSD3Q9NYI0 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PSD3Q9NYI0 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
PSD3Q9NYI0 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PSD3Q9NYI0 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PSD3Q9NYI0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PSD3Q9NYI0 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PSD3Q9NYI0 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSD3Q9NYI0 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSD3Q9NYI0 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSD3Q9NYI0 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PSD3Q9NYI0 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSD3Q9NYI0 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSD3Q9NYI0 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PSD3Q9NYI0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PSD3Q9NYI0 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PSD3Q9NYI0 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSD3Q9NYI0 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSD3Q9NYI0 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSD3Q9NYI0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSD3Q9NYI0 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSD3Q9NYI0 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSD3Q9NYI0 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSD3Q9NYI0 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSD3Q9NYI0 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSD3Q9NYI0 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSD3Q9NYI0 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSD3Q9NYI0 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSD3Q9NYI0 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSD3Q9NYI0 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSD3Q9NYI0 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSD3Q9NYI0 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSD3Q9NYI0 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSD3Q9NYI0 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSD3Q9NYI0 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSD3Q9NYI0 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSD3Q9NYI0 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSD3Q9NYI0 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSD3Q9NYI0 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSD3Q9NYI0 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSD3Q9NYI0 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSD3Q9NYI0 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSD3Q9NYI0 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSD3Q9NYI0 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSD3Q9NYI0 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSD3Q9NYI0 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSD3Q9NYI0 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PSD3Q9NYI0 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PSD3Q9NYI0 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PSD3Q9NYI0 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PSD3Q9NYI0 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PSD3Q9NYI0 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSD3Q9NYI0 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSD3Q9NYI0 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSD3Q9NYI0 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PSD3Q9NYI0 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSD3Q9NYI0 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSD3Q9NYI0 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSD3Q9NYI0 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PSD3Q9NYI0 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSD3Q9NYI0 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSD3Q9NYI0 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSD3Q9NYI0 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSD3Q9NYI0 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSD3Q9NYI0 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSD3Q9NYI0 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSD3Q9NYI0 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSD3Q9NYI0 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSD3Q9NYI0 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSD3Q9NYI0 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSD3Q9NYI0 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSD3Q9NYI0 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSD3Q9NYI0 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSD3Q9NYI0 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSD3Q9NYI0 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PSD3Q9NYI0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PSD3Q9NYI0 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PSD3Q9NYI0 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PSD3Q9NYI0 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PSD3Q9NYI0 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PSD3Q9NYI0 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PSD3Q9NYI0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSD3Q9NYI0 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSD3Q9NYI0 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms