Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA2

KCND1, Potassium voltage-gated channel subfamily D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCND1Q9NSA2 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KCND1Q9NSA2 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KCND1Q9NSA2 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KCND1Q9NSA2 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KCND1Q9NSA2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KCND1Q9NSA2 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KCND1Q9NSA2 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KCND1Q9NSA2 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KCND1Q9NSA2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KCND1Q9NSA2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KCND1Q9NSA2 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
KCND1Q9NSA2 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
KCND1Q9NSA2 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
KCND1Q9NSA2 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
KCND1Q9NSA2 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
KCND1Q9NSA2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KCND1Q9NSA2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KCND1Q9NSA2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KCND1Q9NSA2 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KCND1Q9NSA2 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KCND1Q9NSA2 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KCND1Q9NSA2 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KCND1Q9NSA2 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KCND1Q9NSA2 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KCND1Q9NSA2 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KCND1Q9NSA2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KCND1Q9NSA2 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
KCND1Q9NSA2 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KCND1Q9NSA2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KCND1Q9NSA2 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KCND1Q9NSA2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KCND1Q9NSA2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KCND1Q9NSA2 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KCND1Q9NSA2 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KCND1Q9NSA2 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KCND1Q9NSA2 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KCND1Q9NSA2 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KCND1Q9NSA2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KCND1Q9NSA2 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
KCND1Q9NSA2 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KCND1Q9NSA2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KCND1Q9NSA2 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KCND1Q9NSA2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KCND1Q9NSA2 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KCND1Q9NSA2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KCND1Q9NSA2 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KCND1Q9NSA2 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KCND1Q9NSA2 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KCND1Q9NSA2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KCND1Q9NSA2 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KCND1Q9NSA2 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KCND1Q9NSA2 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KCND1Q9NSA2 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KCND1Q9NSA2 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KCND1Q9NSA2 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KCND1Q9NSA2 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KCND1Q9NSA2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KCND1Q9NSA2 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KCND1Q9NSA2 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KCND1Q9NSA2 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KCND1Q9NSA2 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KCND1Q9NSA2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KCND1Q9NSA2 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KCND1Q9NSA2 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KCND1Q9NSA2 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
KCND1Q9NSA2 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KCND1Q9NSA2 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KCND1Q9NSA2 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KCND1Q9NSA2 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KCND1Q9NSA2 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KCND1Q9NSA2 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KCND1Q9NSA2 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KCND1Q9NSA2 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KCND1Q9NSA2 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KCND1Q9NSA2 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KCND1Q9NSA2 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KCND1Q9NSA2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KCND1Q9NSA2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KCND1Q9NSA2 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KCND1Q9NSA2 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KCND1Q9NSA2 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KCND1Q9NSA2 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KCND1Q9NSA2 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KCND1Q9NSA2 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KCND1Q9NSA2 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
KCND1Q9NSA2 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KCND1Q9NSA2 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KCND1Q9NSA2 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KCND1Q9NSA2 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
KCND1Q9NSA2 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KCND1Q9NSA2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KCND1Q9NSA2 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KCND1Q9NSA2 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KCND1Q9NSA2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KCND1Q9NSA2 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KCND1Q9NSA2 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KCND1Q9NSA2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KCND1Q9NSA2 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KCND1Q9NSA2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KCND1Q9NSA2 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms