Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPB6

PARD6A, Partitioning defective 6 homolog alpha, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARD6AQ9NPB6 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PARD6AQ9NPB6 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PARD6AQ9NPB6 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PARD6AQ9NPB6 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PARD6AQ9NPB6 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PARD6AQ9NPB6 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PARD6AQ9NPB6 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PARD6AQ9NPB6 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PARD6AQ9NPB6 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PARD6AQ9NPB6 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PARD6AQ9NPB6 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PARD6AQ9NPB6 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PARD6AQ9NPB6 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PARD6AQ9NPB6 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PARD6AQ9NPB6 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PARD6AQ9NPB6 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PARD6AQ9NPB6 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PARD6AQ9NPB6 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PARD6AQ9NPB6 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PARD6AQ9NPB6 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PARD6AQ9NPB6 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PARD6AQ9NPB6 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PARD6AQ9NPB6 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PARD6AQ9NPB6 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PARD6AQ9NPB6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PARD6AQ9NPB6 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PARD6AQ9NPB6 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PARD6AQ9NPB6 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PARD6AQ9NPB6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PARD6AQ9NPB6 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PARD6AQ9NPB6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PARD6AQ9NPB6 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PARD6AQ9NPB6 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PARD6AQ9NPB6 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PARD6AQ9NPB6 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PARD6AQ9NPB6 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PARD6AQ9NPB6 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PARD6AQ9NPB6 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PARD6AQ9NPB6 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PARD6AQ9NPB6 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PARD6AQ9NPB6 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PARD6AQ9NPB6 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PARD6AQ9NPB6 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PARD6AQ9NPB6 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PARD6AQ9NPB6 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PARD6AQ9NPB6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PARD6AQ9NPB6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PARD6AQ9NPB6 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PARD6AQ9NPB6 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PARD6AQ9NPB6 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PARD6AQ9NPB6 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PARD6AQ9NPB6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PARD6AQ9NPB6 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PARD6AQ9NPB6 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PARD6AQ9NPB6 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PARD6AQ9NPB6 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PARD6AQ9NPB6 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PARD6AQ9NPB6 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PARD6AQ9NPB6 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PARD6AQ9NPB6 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PARD6AQ9NPB6 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PARD6AQ9NPB6 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PARD6AQ9NPB6 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PARD6AQ9NPB6 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PARD6AQ9NPB6 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PARD6AQ9NPB6 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PARD6AQ9NPB6 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PARD6AQ9NPB6 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PARD6AQ9NPB6 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PARD6AQ9NPB6 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PARD6AQ9NPB6 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PARD6AQ9NPB6 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PARD6AQ9NPB6 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PARD6AQ9NPB6 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PARD6AQ9NPB6 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PARD6AQ9NPB6 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PARD6AQ9NPB6 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PARD6AQ9NPB6 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PARD6AQ9NPB6 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PARD6AQ9NPB6 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PARD6AQ9NPB6 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PARD6AQ9NPB6 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PARD6AQ9NPB6 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PARD6AQ9NPB6 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PARD6AQ9NPB6 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PARD6AQ9NPB6 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PARD6AQ9NPB6 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PARD6AQ9NPB6 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PARD6AQ9NPB6 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PARD6AQ9NPB6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PARD6AQ9NPB6 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PARD6AQ9NPB6 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PARD6AQ9NPB6 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PARD6AQ9NPB6 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PARD6AQ9NPB6 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PARD6AQ9NPB6 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PARD6AQ9NPB6 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PARD6AQ9NPB6 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PARD6AQ9NPB6 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PARD6AQ9NPB6 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms