Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PHACTR1Q9C0D0 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PHACTR1Q9C0D0 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PHACTR1Q9C0D0 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PHACTR1Q9C0D0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PHACTR1Q9C0D0 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PHACTR1Q9C0D0 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PHACTR1Q9C0D0 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PHACTR1Q9C0D0 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PHACTR1Q9C0D0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PHACTR1Q9C0D0 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PHACTR1Q9C0D0 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PHACTR1Q9C0D0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PHACTR1Q9C0D0 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PHACTR1Q9C0D0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PHACTR1Q9C0D0 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PHACTR1Q9C0D0 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PHACTR1Q9C0D0 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PHACTR1Q9C0D0 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PHACTR1Q9C0D0 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PHACTR1Q9C0D0 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PHACTR1Q9C0D0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PHACTR1Q9C0D0 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PHACTR1Q9C0D0 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PHACTR1Q9C0D0 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PHACTR1Q9C0D0 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PHACTR1Q9C0D0 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PHACTR1Q9C0D0 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PHACTR1Q9C0D0 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PHACTR1Q9C0D0 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PHACTR1Q9C0D0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PHACTR1Q9C0D0 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PHACTR1Q9C0D0 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PHACTR1Q9C0D0 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PHACTR1Q9C0D0 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PHACTR1Q9C0D0 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PHACTR1Q9C0D0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PHACTR1Q9C0D0 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PHACTR1Q9C0D0 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PHACTR1Q9C0D0 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PHACTR1Q9C0D0 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PHACTR1Q9C0D0 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PHACTR1Q9C0D0 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PHACTR1Q9C0D0 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PHACTR1Q9C0D0 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PHACTR1Q9C0D0 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PHACTR1Q9C0D0 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PHACTR1Q9C0D0 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PHACTR1Q9C0D0 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PHACTR1Q9C0D0 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PHACTR1Q9C0D0 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PHACTR1Q9C0D0 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PHACTR1Q9C0D0 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PHACTR1Q9C0D0 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PHACTR1Q9C0D0 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PHACTR1Q9C0D0 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PHACTR1Q9C0D0 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PHACTR1Q9C0D0 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PHACTR1Q9C0D0 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PHACTR1Q9C0D0 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PHACTR1Q9C0D0 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PHACTR1Q9C0D0 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PHACTR1Q9C0D0 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PHACTR1Q9C0D0 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PHACTR1Q9C0D0 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PHACTR1Q9C0D0 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PHACTR1Q9C0D0 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PHACTR1Q9C0D0 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PHACTR1Q9C0D0 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PHACTR1Q9C0D0 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PHACTR1Q9C0D0 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PHACTR1Q9C0D0 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PHACTR1Q9C0D0 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PHACTR1Q9C0D0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PHACTR1Q9C0D0 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PHACTR1Q9C0D0 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PHACTR1Q9C0D0 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PHACTR1Q9C0D0 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PHACTR1Q9C0D0 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PHACTR1Q9C0D0 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PHACTR1Q9C0D0 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PHACTR1Q9C0D0 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PHACTR1Q9C0D0 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PHACTR1Q9C0D0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PHACTR1Q9C0D0 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PHACTR1Q9C0D0 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PHACTR1Q9C0D0 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PHACTR1Q9C0D0 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PHACTR1Q9C0D0 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PHACTR1Q9C0D0 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PHACTR1Q9C0D0 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PHACTR1Q9C0D0 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PHACTR1Q9C0D0 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PHACTR1Q9C0D0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PHACTR1Q9C0D0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PHACTR1Q9C0D0 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PHACTR1Q9C0D0 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PHACTR1Q9C0D0 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PHACTR1Q9C0D0 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PHACTR1Q9C0D0 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 733.7 ms