Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZK3

NACAP1, Putative nascent polypeptide-associated complex subunit alpha-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NACAP1Q9BZK3 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
NACAP1Q9BZK3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NACAP1Q9BZK3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NACAP1Q9BZK3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NACAP1Q9BZK3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
NACAP1Q9BZK3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NACAP1Q9BZK3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NACAP1Q9BZK3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NACAP1Q9BZK3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NACAP1Q9BZK3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NACAP1Q9BZK3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
NACAP1Q9BZK3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
NACAP1Q9BZK3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NACAP1Q9BZK3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NACAP1Q9BZK3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NACAP1Q9BZK3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NACAP1Q9BZK3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NACAP1Q9BZK3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NACAP1Q9BZK3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NACAP1Q9BZK3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NACAP1Q9BZK3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
NACAP1Q9BZK3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NACAP1Q9BZK3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NACAP1Q9BZK3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NACAP1Q9BZK3 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
NACAP1Q9BZK3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NACAP1Q9BZK3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NACAP1Q9BZK3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NACAP1Q9BZK3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NACAP1Q9BZK3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NACAP1Q9BZK3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NACAP1Q9BZK3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NACAP1Q9BZK3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NACAP1Q9BZK3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NACAP1Q9BZK3 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NACAP1Q9BZK3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NACAP1Q9BZK3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NACAP1Q9BZK3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NACAP1Q9BZK3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NACAP1Q9BZK3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NACAP1Q9BZK3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NACAP1Q9BZK3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NACAP1Q9BZK3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NACAP1Q9BZK3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NACAP1Q9BZK3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NACAP1Q9BZK3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NACAP1Q9BZK3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NACAP1Q9BZK3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NACAP1Q9BZK3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NACAP1Q9BZK3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NACAP1Q9BZK3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NACAP1Q9BZK3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
NACAP1Q9BZK3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NACAP1Q9BZK3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NACAP1Q9BZK3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NACAP1Q9BZK3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NACAP1Q9BZK3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NACAP1Q9BZK3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NACAP1Q9BZK3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NACAP1Q9BZK3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NACAP1Q9BZK3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NACAP1Q9BZK3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NACAP1Q9BZK3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NACAP1Q9BZK3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NACAP1Q9BZK3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NACAP1Q9BZK3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NACAP1Q9BZK3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NACAP1Q9BZK3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NACAP1Q9BZK3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NACAP1Q9BZK3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NACAP1Q9BZK3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NACAP1Q9BZK3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NACAP1Q9BZK3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NACAP1Q9BZK3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
NACAP1Q9BZK3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NACAP1Q9BZK3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NACAP1Q9BZK3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NACAP1Q9BZK3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NACAP1Q9BZK3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NACAP1Q9BZK3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NACAP1Q9BZK3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NACAP1Q9BZK3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NACAP1Q9BZK3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NACAP1Q9BZK3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NACAP1Q9BZK3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NACAP1Q9BZK3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NACAP1Q9BZK3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NACAP1Q9BZK3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NACAP1Q9BZK3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NACAP1Q9BZK3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NACAP1Q9BZK3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NACAP1Q9BZK3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NACAP1Q9BZK3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NACAP1Q9BZK3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NACAP1Q9BZK3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NACAP1Q9BZK3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
NACAP1Q9BZK3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NACAP1Q9BZK3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NACAP1Q9BZK3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NACAP1Q9BZK3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms