Protein–RNA interactions for Protein: Q99963

SH3GL3, Endophilin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GL3Q99963 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SH3GL3Q99963 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SH3GL3Q99963 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SH3GL3Q99963 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SH3GL3Q99963 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SH3GL3Q99963 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SH3GL3Q99963 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SH3GL3Q99963 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SH3GL3Q99963 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SH3GL3Q99963 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SH3GL3Q99963 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SH3GL3Q99963 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SH3GL3Q99963 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SH3GL3Q99963 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SH3GL3Q99963 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SH3GL3Q99963 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SH3GL3Q99963 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SH3GL3Q99963 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SH3GL3Q99963 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SH3GL3Q99963 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SH3GL3Q99963 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SH3GL3Q99963 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
SH3GL3Q99963 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SH3GL3Q99963 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SH3GL3Q99963 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SH3GL3Q99963 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SH3GL3Q99963 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SH3GL3Q99963 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SH3GL3Q99963 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SH3GL3Q99963 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SH3GL3Q99963 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SH3GL3Q99963 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SH3GL3Q99963 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SH3GL3Q99963 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SH3GL3Q99963 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SH3GL3Q99963 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SH3GL3Q99963 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SH3GL3Q99963 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SH3GL3Q99963 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SH3GL3Q99963 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SH3GL3Q99963 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SH3GL3Q99963 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SH3GL3Q99963 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SH3GL3Q99963 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SH3GL3Q99963 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SH3GL3Q99963 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SH3GL3Q99963 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SH3GL3Q99963 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SH3GL3Q99963 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SH3GL3Q99963 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SH3GL3Q99963 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SH3GL3Q99963 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SH3GL3Q99963 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SH3GL3Q99963 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SH3GL3Q99963 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SH3GL3Q99963 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SH3GL3Q99963 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SH3GL3Q99963 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SH3GL3Q99963 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SH3GL3Q99963 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SH3GL3Q99963 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SH3GL3Q99963 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SH3GL3Q99963 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SH3GL3Q99963 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SH3GL3Q99963 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SH3GL3Q99963 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SH3GL3Q99963 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SH3GL3Q99963 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SH3GL3Q99963 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SH3GL3Q99963 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SH3GL3Q99963 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SH3GL3Q99963 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SH3GL3Q99963 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SH3GL3Q99963 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SH3GL3Q99963 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SH3GL3Q99963 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SH3GL3Q99963 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SH3GL3Q99963 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SH3GL3Q99963 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SH3GL3Q99963 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SH3GL3Q99963 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SH3GL3Q99963 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SH3GL3Q99963 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SH3GL3Q99963 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SH3GL3Q99963 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SH3GL3Q99963 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SH3GL3Q99963 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SH3GL3Q99963 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SH3GL3Q99963 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SH3GL3Q99963 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SH3GL3Q99963 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SH3GL3Q99963 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SH3GL3Q99963 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SH3GL3Q99963 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SH3GL3Q99963 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SH3GL3Q99963 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SH3GL3Q99963 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SH3GL3Q99963 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SH3GL3Q99963 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SH3GL3Q99963 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms