Protein–RNA interactions for Protein: Q99795

GPA33, Cell surface A33 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPA33Q99795 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GPA33Q99795 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPA33Q99795 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPA33Q99795 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPA33Q99795 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPA33Q99795 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPA33Q99795 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPA33Q99795 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPA33Q99795 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPA33Q99795 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPA33Q99795 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPA33Q99795 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPA33Q99795 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPA33Q99795 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPA33Q99795 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GPA33Q99795 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPA33Q99795 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPA33Q99795 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GPA33Q99795 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GPA33Q99795 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GPA33Q99795 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GPA33Q99795 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GPA33Q99795 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GPA33Q99795 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GPA33Q99795 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GPA33Q99795 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GPA33Q99795 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GPA33Q99795 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GPA33Q99795 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GPA33Q99795 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GPA33Q99795 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPA33Q99795 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPA33Q99795 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPA33Q99795 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPA33Q99795 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPA33Q99795 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPA33Q99795 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPA33Q99795 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPA33Q99795 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPA33Q99795 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPA33Q99795 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPA33Q99795 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPA33Q99795 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPA33Q99795 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPA33Q99795 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPA33Q99795 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPA33Q99795 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPA33Q99795 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPA33Q99795 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPA33Q99795 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPA33Q99795 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPA33Q99795 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPA33Q99795 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPA33Q99795 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPA33Q99795 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
GPA33Q99795 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GPA33Q99795 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GPA33Q99795 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GPA33Q99795 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GPA33Q99795 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GPA33Q99795 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GPA33Q99795 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GPA33Q99795 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GPA33Q99795 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GPA33Q99795 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GPA33Q99795 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GPA33Q99795 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GPA33Q99795 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GPA33Q99795 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GPA33Q99795 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GPA33Q99795 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GPA33Q99795 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GPA33Q99795 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GPA33Q99795 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
GPA33Q99795 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GPA33Q99795 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GPA33Q99795 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
GPA33Q99795 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
GPA33Q99795 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GPA33Q99795 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GPA33Q99795 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GPA33Q99795 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GPA33Q99795 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GPA33Q99795 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GPA33Q99795 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GPA33Q99795 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GPA33Q99795 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GPA33Q99795 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GPA33Q99795 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GPA33Q99795 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GPA33Q99795 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GPA33Q99795 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GPA33Q99795 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GPA33Q99795 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
GPA33Q99795 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GPA33Q99795 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GPA33Q99795 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GPA33Q99795 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GPA33Q99795 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GPA33Q99795 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms