Protein–RNA interactions for Protein: Q96PP9

GBP4, Guanylate-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP4Q96PP9 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GBP4Q96PP9 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GBP4Q96PP9 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GBP4Q96PP9 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GBP4Q96PP9 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GBP4Q96PP9 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GBP4Q96PP9 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GBP4Q96PP9 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GBP4Q96PP9 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GBP4Q96PP9 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GBP4Q96PP9 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GBP4Q96PP9 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GBP4Q96PP9 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GBP4Q96PP9 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GBP4Q96PP9 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GBP4Q96PP9 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GBP4Q96PP9 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GBP4Q96PP9 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GBP4Q96PP9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GBP4Q96PP9 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GBP4Q96PP9 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GBP4Q96PP9 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GBP4Q96PP9 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GBP4Q96PP9 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GBP4Q96PP9 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GBP4Q96PP9 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GBP4Q96PP9 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GBP4Q96PP9 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GBP4Q96PP9 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GBP4Q96PP9 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GBP4Q96PP9 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
GBP4Q96PP9 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
GBP4Q96PP9 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GBP4Q96PP9 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
GBP4Q96PP9 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GBP4Q96PP9 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GBP4Q96PP9 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GBP4Q96PP9 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GBP4Q96PP9 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GBP4Q96PP9 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GBP4Q96PP9 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GBP4Q96PP9 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
GBP4Q96PP9 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GBP4Q96PP9 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GBP4Q96PP9 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GBP4Q96PP9 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GBP4Q96PP9 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GBP4Q96PP9 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GBP4Q96PP9 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GBP4Q96PP9 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GBP4Q96PP9 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GBP4Q96PP9 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GBP4Q96PP9 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GBP4Q96PP9 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GBP4Q96PP9 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GBP4Q96PP9 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GBP4Q96PP9 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GBP4Q96PP9 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GBP4Q96PP9 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GBP4Q96PP9 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GBP4Q96PP9 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GBP4Q96PP9 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GBP4Q96PP9 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GBP4Q96PP9 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GBP4Q96PP9 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GBP4Q96PP9 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GBP4Q96PP9 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GBP4Q96PP9 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GBP4Q96PP9 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GBP4Q96PP9 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GBP4Q96PP9 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GBP4Q96PP9 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GBP4Q96PP9 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GBP4Q96PP9 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
GBP4Q96PP9 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GBP4Q96PP9 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GBP4Q96PP9 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GBP4Q96PP9 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GBP4Q96PP9 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GBP4Q96PP9 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GBP4Q96PP9 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
GBP4Q96PP9 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GBP4Q96PP9 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GBP4Q96PP9 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.55■■■□□ 2
GBP4Q96PP9 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.55■■■□□ 2
GBP4Q96PP9 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
GBP4Q96PP9 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
GBP4Q96PP9 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GBP4Q96PP9 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
GBP4Q96PP9 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GBP4Q96PP9 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
GBP4Q96PP9 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GBP4Q96PP9 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GBP4Q96PP9 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GBP4Q96PP9 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
GBP4Q96PP9 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GBP4Q96PP9 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
GBP4Q96PP9 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
GBP4Q96PP9 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GBP4Q96PP9 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms