Protein–RNA interactions for Protein: Q96M27

PRRC1, Protein PRRC1, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRC1Q96M27 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRRC1Q96M27 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRRC1Q96M27 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRRC1Q96M27 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRRC1Q96M27 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRRC1Q96M27 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PRRC1Q96M27 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRRC1Q96M27 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PRRC1Q96M27 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRRC1Q96M27 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRRC1Q96M27 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PRRC1Q96M27 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PRRC1Q96M27 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PRRC1Q96M27 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRRC1Q96M27 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRRC1Q96M27 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRRC1Q96M27 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRRC1Q96M27 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRRC1Q96M27 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRRC1Q96M27 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRRC1Q96M27 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRRC1Q96M27 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRRC1Q96M27 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRRC1Q96M27 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRRC1Q96M27 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRRC1Q96M27 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRRC1Q96M27 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRRC1Q96M27 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRRC1Q96M27 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRRC1Q96M27 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRRC1Q96M27 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRRC1Q96M27 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRRC1Q96M27 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRRC1Q96M27 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRRC1Q96M27 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRRC1Q96M27 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRRC1Q96M27 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRRC1Q96M27 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRRC1Q96M27 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRRC1Q96M27 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRRC1Q96M27 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRRC1Q96M27 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRRC1Q96M27 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRRC1Q96M27 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRRC1Q96M27 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRRC1Q96M27 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRRC1Q96M27 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRRC1Q96M27 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PRRC1Q96M27 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRRC1Q96M27 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRRC1Q96M27 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PRRC1Q96M27 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRRC1Q96M27 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRRC1Q96M27 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRRC1Q96M27 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRRC1Q96M27 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRRC1Q96M27 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRRC1Q96M27 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PRRC1Q96M27 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRRC1Q96M27 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRRC1Q96M27 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRRC1Q96M27 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRRC1Q96M27 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRRC1Q96M27 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRRC1Q96M27 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
PRRC1Q96M27 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRRC1Q96M27 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PRRC1Q96M27 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRRC1Q96M27 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRRC1Q96M27 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRRC1Q96M27 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRRC1Q96M27 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRRC1Q96M27 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRRC1Q96M27 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRRC1Q96M27 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PRRC1Q96M27 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRRC1Q96M27 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRRC1Q96M27 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRRC1Q96M27 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRRC1Q96M27 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRRC1Q96M27 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PRRC1Q96M27 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRRC1Q96M27 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRRC1Q96M27 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRRC1Q96M27 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRRC1Q96M27 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRRC1Q96M27 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PRRC1Q96M27 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRRC1Q96M27 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRRC1Q96M27 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRRC1Q96M27 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRRC1Q96M27 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRRC1Q96M27 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRRC1Q96M27 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRRC1Q96M27 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRRC1Q96M27 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRRC1Q96M27 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRRC1Q96M27 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRRC1Q96M27 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRRC1Q96M27 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68 ms