Protein–RNA interactions for Protein: Q96LZ7

RMDN2, Regulator of microtubule dynamics protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RMDN2Q96LZ7 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RMDN2Q96LZ7 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RMDN2Q96LZ7 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RMDN2Q96LZ7 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RMDN2Q96LZ7 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RMDN2Q96LZ7 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RMDN2Q96LZ7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RMDN2Q96LZ7 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RMDN2Q96LZ7 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RMDN2Q96LZ7 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RMDN2Q96LZ7 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RMDN2Q96LZ7 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RMDN2Q96LZ7 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RMDN2Q96LZ7 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RMDN2Q96LZ7 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RMDN2Q96LZ7 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RMDN2Q96LZ7 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RMDN2Q96LZ7 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
RMDN2Q96LZ7 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RMDN2Q96LZ7 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RMDN2Q96LZ7 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RMDN2Q96LZ7 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RMDN2Q96LZ7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RMDN2Q96LZ7 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RMDN2Q96LZ7 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RMDN2Q96LZ7 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RMDN2Q96LZ7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RMDN2Q96LZ7 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RMDN2Q96LZ7 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RMDN2Q96LZ7 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RMDN2Q96LZ7 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RMDN2Q96LZ7 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RMDN2Q96LZ7 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RMDN2Q96LZ7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RMDN2Q96LZ7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RMDN2Q96LZ7 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RMDN2Q96LZ7 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RMDN2Q96LZ7 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RMDN2Q96LZ7 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RMDN2Q96LZ7 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RMDN2Q96LZ7 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
RMDN2Q96LZ7 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
RMDN2Q96LZ7 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RMDN2Q96LZ7 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RMDN2Q96LZ7 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RMDN2Q96LZ7 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RMDN2Q96LZ7 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RMDN2Q96LZ7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RMDN2Q96LZ7 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RMDN2Q96LZ7 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RMDN2Q96LZ7 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RMDN2Q96LZ7 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RMDN2Q96LZ7 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RMDN2Q96LZ7 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RMDN2Q96LZ7 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RMDN2Q96LZ7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RMDN2Q96LZ7 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RMDN2Q96LZ7 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RMDN2Q96LZ7 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RMDN2Q96LZ7 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RMDN2Q96LZ7 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RMDN2Q96LZ7 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RMDN2Q96LZ7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RMDN2Q96LZ7 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RMDN2Q96LZ7 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RMDN2Q96LZ7 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RMDN2Q96LZ7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RMDN2Q96LZ7 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RMDN2Q96LZ7 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RMDN2Q96LZ7 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
RMDN2Q96LZ7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RMDN2Q96LZ7 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RMDN2Q96LZ7 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RMDN2Q96LZ7 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RMDN2Q96LZ7 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RMDN2Q96LZ7 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RMDN2Q96LZ7 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RMDN2Q96LZ7 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
RMDN2Q96LZ7 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RMDN2Q96LZ7 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RMDN2Q96LZ7 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RMDN2Q96LZ7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RMDN2Q96LZ7 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RMDN2Q96LZ7 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RMDN2Q96LZ7 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RMDN2Q96LZ7 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RMDN2Q96LZ7 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RMDN2Q96LZ7 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RMDN2Q96LZ7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RMDN2Q96LZ7 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RMDN2Q96LZ7 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RMDN2Q96LZ7 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RMDN2Q96LZ7 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RMDN2Q96LZ7 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RMDN2Q96LZ7 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RMDN2Q96LZ7 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RMDN2Q96LZ7 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RMDN2Q96LZ7 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RMDN2Q96LZ7 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RMDN2Q96LZ7 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms