Protein–RNA interactions for Protein: Q96HL8

SH3YL1, SH3 domain-containing YSC84-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3YL1Q96HL8 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SH3YL1Q96HL8 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SH3YL1Q96HL8 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SH3YL1Q96HL8 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SH3YL1Q96HL8 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SH3YL1Q96HL8 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SH3YL1Q96HL8 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SH3YL1Q96HL8 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SH3YL1Q96HL8 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SH3YL1Q96HL8 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SH3YL1Q96HL8 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SH3YL1Q96HL8 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SH3YL1Q96HL8 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SH3YL1Q96HL8 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SH3YL1Q96HL8 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SH3YL1Q96HL8 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SH3YL1Q96HL8 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SH3YL1Q96HL8 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SH3YL1Q96HL8 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SH3YL1Q96HL8 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SH3YL1Q96HL8 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SH3YL1Q96HL8 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SH3YL1Q96HL8 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SH3YL1Q96HL8 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SH3YL1Q96HL8 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SH3YL1Q96HL8 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SH3YL1Q96HL8 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SH3YL1Q96HL8 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SH3YL1Q96HL8 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SH3YL1Q96HL8 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SH3YL1Q96HL8 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SH3YL1Q96HL8 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SH3YL1Q96HL8 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SH3YL1Q96HL8 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SH3YL1Q96HL8 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SH3YL1Q96HL8 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SH3YL1Q96HL8 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SH3YL1Q96HL8 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SH3YL1Q96HL8 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SH3YL1Q96HL8 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SH3YL1Q96HL8 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SH3YL1Q96HL8 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SH3YL1Q96HL8 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SH3YL1Q96HL8 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SH3YL1Q96HL8 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SH3YL1Q96HL8 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SH3YL1Q96HL8 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SH3YL1Q96HL8 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SH3YL1Q96HL8 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SH3YL1Q96HL8 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SH3YL1Q96HL8 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SH3YL1Q96HL8 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SH3YL1Q96HL8 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SH3YL1Q96HL8 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SH3YL1Q96HL8 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SH3YL1Q96HL8 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH3YL1Q96HL8 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH3YL1Q96HL8 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH3YL1Q96HL8 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH3YL1Q96HL8 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH3YL1Q96HL8 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH3YL1Q96HL8 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH3YL1Q96HL8 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH3YL1Q96HL8 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH3YL1Q96HL8 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH3YL1Q96HL8 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH3YL1Q96HL8 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH3YL1Q96HL8 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH3YL1Q96HL8 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH3YL1Q96HL8 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH3YL1Q96HL8 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH3YL1Q96HL8 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH3YL1Q96HL8 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH3YL1Q96HL8 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH3YL1Q96HL8 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SH3YL1Q96HL8 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SH3YL1Q96HL8 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH3YL1Q96HL8 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH3YL1Q96HL8 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH3YL1Q96HL8 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SH3YL1Q96HL8 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SH3YL1Q96HL8 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SH3YL1Q96HL8 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SH3YL1Q96HL8 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SH3YL1Q96HL8 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SH3YL1Q96HL8 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
SH3YL1Q96HL8 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH3YL1Q96HL8 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH3YL1Q96HL8 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH3YL1Q96HL8 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH3YL1Q96HL8 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH3YL1Q96HL8 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SH3YL1Q96HL8 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH3YL1Q96HL8 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH3YL1Q96HL8 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH3YL1Q96HL8 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH3YL1Q96HL8 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SH3YL1Q96HL8 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH3YL1Q96HL8 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH3YL1Q96HL8 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms