Protein–RNA interactions for Protein: Q96GY0

ZC2HC1A, Zinc finger C2HC domain-containing protein 1A, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC2HC1AQ96GY0 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZC2HC1AQ96GY0 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZC2HC1AQ96GY0 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZC2HC1AQ96GY0 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZC2HC1AQ96GY0 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZC2HC1AQ96GY0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZC2HC1AQ96GY0 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZC2HC1AQ96GY0 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZC2HC1AQ96GY0 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZC2HC1AQ96GY0 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ZC2HC1AQ96GY0 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZC2HC1AQ96GY0 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZC2HC1AQ96GY0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZC2HC1AQ96GY0 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZC2HC1AQ96GY0 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZC2HC1AQ96GY0 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZC2HC1AQ96GY0 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZC2HC1AQ96GY0 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZC2HC1AQ96GY0 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZC2HC1AQ96GY0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZC2HC1AQ96GY0 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZC2HC1AQ96GY0 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZC2HC1AQ96GY0 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZC2HC1AQ96GY0 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZC2HC1AQ96GY0 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ZC2HC1AQ96GY0 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZC2HC1AQ96GY0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZC2HC1AQ96GY0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZC2HC1AQ96GY0 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ZC2HC1AQ96GY0 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZC2HC1AQ96GY0 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZC2HC1AQ96GY0 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZC2HC1AQ96GY0 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZC2HC1AQ96GY0 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZC2HC1AQ96GY0 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZC2HC1AQ96GY0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZC2HC1AQ96GY0 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZC2HC1AQ96GY0 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZC2HC1AQ96GY0 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZC2HC1AQ96GY0 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ZC2HC1AQ96GY0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ZC2HC1AQ96GY0 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZC2HC1AQ96GY0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZC2HC1AQ96GY0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZC2HC1AQ96GY0 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZC2HC1AQ96GY0 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZC2HC1AQ96GY0 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZC2HC1AQ96GY0 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZC2HC1AQ96GY0 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ZC2HC1AQ96GY0 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZC2HC1AQ96GY0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZC2HC1AQ96GY0 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZC2HC1AQ96GY0 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZC2HC1AQ96GY0 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZC2HC1AQ96GY0 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZC2HC1AQ96GY0 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZC2HC1AQ96GY0 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZC2HC1AQ96GY0 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZC2HC1AQ96GY0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZC2HC1AQ96GY0 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZC2HC1AQ96GY0 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZC2HC1AQ96GY0 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZC2HC1AQ96GY0 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZC2HC1AQ96GY0 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZC2HC1AQ96GY0 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZC2HC1AQ96GY0 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZC2HC1AQ96GY0 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZC2HC1AQ96GY0 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZC2HC1AQ96GY0 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZC2HC1AQ96GY0 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZC2HC1AQ96GY0 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZC2HC1AQ96GY0 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZC2HC1AQ96GY0 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZC2HC1AQ96GY0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZC2HC1AQ96GY0 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZC2HC1AQ96GY0 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZC2HC1AQ96GY0 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZC2HC1AQ96GY0 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZC2HC1AQ96GY0 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZC2HC1AQ96GY0 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZC2HC1AQ96GY0 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZC2HC1AQ96GY0 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZC2HC1AQ96GY0 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZC2HC1AQ96GY0 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZC2HC1AQ96GY0 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZC2HC1AQ96GY0 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZC2HC1AQ96GY0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZC2HC1AQ96GY0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZC2HC1AQ96GY0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZC2HC1AQ96GY0 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZC2HC1AQ96GY0 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ZC2HC1AQ96GY0 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZC2HC1AQ96GY0 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZC2HC1AQ96GY0 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZC2HC1AQ96GY0 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZC2HC1AQ96GY0 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZC2HC1AQ96GY0 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZC2HC1AQ96GY0 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZC2HC1AQ96GY0 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZC2HC1AQ96GY0 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms