Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
SIRT1Q96EB6 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
SIRT1Q96EB6 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC33.46■■■□□ 2.95
SIRT1Q96EB6 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
SIRT1Q96EB6 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
SIRT1Q96EB6 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
SIRT1Q96EB6 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
SIRT1Q96EB6 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC33.45■■■□□ 2.95
SIRT1Q96EB6 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
SIRT1Q96EB6 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC33.45■■■□□ 2.94
SIRT1Q96EB6 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
SIRT1Q96EB6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
SIRT1Q96EB6 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
SIRT1Q96EB6 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
SIRT1Q96EB6 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
SIRT1Q96EB6 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
SIRT1Q96EB6 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
SIRT1Q96EB6 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC33.43■■■□□ 2.94
SIRT1Q96EB6 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
SIRT1Q96EB6 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
SIRT1Q96EB6 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
SIRT1Q96EB6 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
SIRT1Q96EB6 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
SIRT1Q96EB6 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
SIRT1Q96EB6 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
SIRT1Q96EB6 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
SIRT1Q96EB6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
SIRT1Q96EB6 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
SIRT1Q96EB6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
SIRT1Q96EB6 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
SIRT1Q96EB6 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC33.41■■■□□ 2.94
SIRT1Q96EB6 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
SIRT1Q96EB6 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
SIRT1Q96EB6 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
SIRT1Q96EB6 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
SIRT1Q96EB6 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
SIRT1Q96EB6 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC33.4■■■□□ 2.94
SIRT1Q96EB6 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
SIRT1Q96EB6 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
SIRT1Q96EB6 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC33.38■■■□□ 2.93
SIRT1Q96EB6 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC33.38■■■□□ 2.93
SIRT1Q96EB6 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
SIRT1Q96EB6 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
SIRT1Q96EB6 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
SIRT1Q96EB6 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
SIRT1Q96EB6 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
SIRT1Q96EB6 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
SIRT1Q96EB6 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
SIRT1Q96EB6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
SIRT1Q96EB6 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
SIRT1Q96EB6 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
SIRT1Q96EB6 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
SIRT1Q96EB6 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
SIRT1Q96EB6 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
SIRT1Q96EB6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
SIRT1Q96EB6 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
SIRT1Q96EB6 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
SIRT1Q96EB6 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
SIRT1Q96EB6 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
SIRT1Q96EB6 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC33.35■■■□□ 2.93
SIRT1Q96EB6 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
SIRT1Q96EB6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
SIRT1Q96EB6 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
SIRT1Q96EB6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
SIRT1Q96EB6 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
SIRT1Q96EB6 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
SIRT1Q96EB6 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
SIRT1Q96EB6 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
SIRT1Q96EB6 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
SIRT1Q96EB6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
SIRT1Q96EB6 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
SIRT1Q96EB6 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
SIRT1Q96EB6 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
SIRT1Q96EB6 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
SIRT1Q96EB6 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
SIRT1Q96EB6 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
SIRT1Q96EB6 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
SIRT1Q96EB6 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
SIRT1Q96EB6 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC33.31■■■□□ 2.92
SIRT1Q96EB6 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
SIRT1Q96EB6 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
SIRT1Q96EB6 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
SIRT1Q96EB6 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
SIRT1Q96EB6 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
SIRT1Q96EB6 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
SIRT1Q96EB6 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
SIRT1Q96EB6 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
SIRT1Q96EB6 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
SIRT1Q96EB6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
SIRT1Q96EB6 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
SIRT1Q96EB6 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
SIRT1Q96EB6 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
SIRT1Q96EB6 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
SIRT1Q96EB6 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
SIRT1Q96EB6 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
SIRT1Q96EB6 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
SIRT1Q96EB6 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
SIRT1Q96EB6 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
SIRT1Q96EB6 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
SIRT1Q96EB6 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms