Protein–RNA interactions for Protein: Q969Z0

TBRG4, Protein TBRG4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBRG4Q969Z0 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.653e-9■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 INTS11-220ENST00000493534 896 ntTSL 319.07■□□□□ 0.643e-9■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 INTS11-235ENST00000527719 750 ntTSL 519.03■□□□□ 0.643e-9■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 CRKL-202ENST00000411769 2037 ntTSL 1 (best)18.89■□□□□ 0.613e-9■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 MED26-205ENST00000600060 478 ntTSL 218.82■□□□□ 0.63e-9■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 INTS11-230ENST00000526332 579 ntTSL 418.63■□□□□ 0.573e-9■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 INTS11-224ENST00000498476 554 ntTSL 418.63■□□□□ 0.573e-9■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 INTS11-239ENST00000531019 549 ntTSL 418.63■□□□□ 0.573e-9■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 MYO19-215ENST00000616159 963 ntTSL 218.61■□□□□ 0.572e-12■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.573e-9■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 KHDRBS1-201ENST00000307714 2738 ntTSL 1 (best)18.59■□□□□ 0.573e-9■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 INTS11-219ENST00000490853 704 ntTSL 318.53■□□□□ 0.563e-9■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 TARSL2-202ENST00000539112 2774 ntTSL 1 (best)18.42■□□□□ 0.543e-9■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.533e-9■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.523e-9■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 SPIN1-206ENST00000485804 814 ntTSL 318.26■□□□□ 0.513e-9■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 CLU-214ENST00000523396 426 ntTSL 318.19■□□□□ 0.53e-9■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 CLU-204ENST00000519472 303 ntTSL 218.19■□□□□ 0.53e-9■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 TNRC18-204ENST00000413081 925 ntTSL 318.16■□□□□ 0.53e-9■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.493e-9■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.492e-12■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 MMS19-211ENST00000441194 916 ntTSL 518■□□□□ 0.473e-9■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 MMS19-210ENST00000439048 609 ntTSL 517.97■□□□□ 0.473e-9■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 CYP4F3-207ENST00000592279 2078 ntTSL 217.91■□□□□ 0.463e-9■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.463e-9■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.453e-9■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.453e-9■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 MED26-204ENST00000598608 742 ntTSL 317.85■□□□□ 0.453e-9■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 INTS11-215ENST00000470679 584 ntTSL 517.83■□□□□ 0.443e-9■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 TBC1D5-221ENST00000452492 581 ntTSL 317.81■□□□□ 0.443e-9■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC17.81■□□□□ 0.443e-9■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.443e-9■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 INTS11-221ENST00000496353 2428 ntTSL 217.78■□□□□ 0.443e-9■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.443e-9■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 HAAO-203ENST00000402698 1522 ntTSL 517.77■□□□□ 0.433e-9■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.433e-9■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 TNIP2-204ENST00000505186 980 ntTSL 317.69■□□□□ 0.423e-9■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 INTS11-218ENST00000488042 1134 ntTSL 217.64■□□□□ 0.413e-9■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 EPM2A-215ENST00000639049 3335 ntTSL 1 (best)17.52■□□□□ 0.43e-9■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.383e-9■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 SPIN1-205ENST00000485565 706 ntTSL 317.41■□□□□ 0.383e-9■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 INTS11-237ENST00000530031 800 ntTSL 517.41■□□□□ 0.383e-9■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.373e-9■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 INTS11-207ENST00000434694 1056 ntTSL 517.35■□□□□ 0.373e-9■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.363e-9■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 MMS19-205ENST00000422685 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 517.22■□□□□ 0.353e-9■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 MMS19-208ENST00000437002 933 ntAPPRIS ALT2 TSL 517.22■□□□□ 0.353e-9■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.343e-9■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.343e-9■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.333e-9■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.323e-9■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.323e-9■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.313e-9■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.293e-9■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.293e-9■■■■■ 78.5
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TBRG4Q969Z0 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.283e-9■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.283e-9■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.273e-9■■■■■ 78.5
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TBRG4Q969Z0 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.263e-9■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.266e-7■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.263e-9■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC16.61■□□□□ 0.253e-9■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 ZNF75D-204ENST00000494295 1678 ntTSL 216.59■□□□□ 0.253e-9■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 HAAO-202ENST00000402268 908 ntTSL 216.53■□□□□ 0.243e-9■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 MMS19-213ENST00000448660 776 ntTSL 516.49■□□□□ 0.233e-9■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 CREM-223ENST00000466251 485 ntTSL 516.42■□□□□ 0.223e-9■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 ANXA6-212ENST00000521749 880 ntTSL 316.36■□□□□ 0.213e-9■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 INTS11-232ENST00000526904 551 ntTSL 416.35■□□□□ 0.213e-9■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 TPP2-205ENST00000490010 691 ntTSL 216.35■□□□□ 0.213e-9■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.23e-9■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 CLTB-205ENST00000508425 527 ntTSL 316.31■□□□□ 0.23e-9■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.23e-9■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 ZNF846-208ENST00000589453 1580 ntTSL 1 (best)16.27■□□□□ 0.23e-9■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 AC073111.5-207ENST00000642008 571 nt16.25■□□□□ 0.193e-9■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.183e-9■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 PGF-204ENST00000555234 811 ntTSL 216.19■□□□□ 0.183e-9■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 PGF-207ENST00000556939 1125 ntTSL 216.19■□□□□ 0.183e-9■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.183e-9■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.173e-9■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.179e-7■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.163e-9■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 HAAO-207ENST00000431905 827 ntTSL 315.9■□□□□ 0.143e-9■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 INTS11-201ENST00000323275 2450 ntTSL 1 (best)15.84■□□□□ 0.133e-9■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 INTS11-210ENST00000458452 2571 ntTSL 215.79■□□□□ 0.123e-9■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.123e-9■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 TNIP2-202ENST00000502256 923 ntTSL 215.71■□□□□ 0.113e-9■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 CLU-216ENST00000523589 878 ntTSL 315.71■□□□□ 0.113e-9■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 PPP6R1-206ENST00000591323 848 ntTSL 315.66■□□□□ 0.13e-9■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 TMEM131-209ENST00000489507 568 ntTSL 315.63■□□□□ 0.093e-9■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.093e-9■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 INTS11-233ENST00000527098 2004 ntTSL 215.62■□□□□ 0.093e-9■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 CRLF1-202ENST00000593286 514 ntTSL 415.61■□□□□ 0.093e-9■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.073e-9■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 WRAP53-209ENST00000498311 2657 ntTSL 215.51■□□□□ 0.073e-9■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.063e-9■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.063e-9■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.043e-9■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 CYP4F3-204ENST00000587360 559 ntTSL 415.29■□□□□ 0.043e-9■■■■■ 78.5
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