RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439048.1

MMS19-210, Transcript of MMS19 homolog, cytosolic iron-sulfur assembly component, humanhuman

TSL 5

Gene MMS19, Length 609 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMS19-210ENST00000439048 NISCHQ9Y2I1 1504 aa44.77■■■■■ 4.76
MMS19-210ENST00000439048 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa39.94■■■■□ 3.99
MMS19-210ENST00000439048 ABCC9O60706 1549 aa39.19■■■■□ 3.86
MMS19-210ENST00000439048 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa37.66■■■■□ 3.62
MMS19-210ENST00000439048 NACADO15069 1562 aa37.55■■■■□ 3.6
MMS19-210ENST00000439048 DCAF8L2P0C7V8 631 aa37.43■■■■□ 3.58
MMS19-210ENST00000439048 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP37.28■■■■□ 3.56
MMS19-210ENST00000439048 MYO15BQ96JP2 1530 aa37.26■■■■□ 3.56
MMS19-210ENST00000439048 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa37.05■■■■□ 3.52
MMS19-210ENST00000439048 UNC13AQ9UPW8 1703 aa36.79■■■■□ 3.48
MMS19-210ENST00000439048 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP36.53■■■■□ 3.44
MMS19-210ENST00000439048 BICRAQ9NZM4 1560 aa36.48■■■■□ 3.43
MMS19-210ENST00000439048 SCRIBQ14160 1630 aa36.43■■■■□ 3.42
MMS19-210ENST00000439048 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa36.15■■■■□ 3.38
MMS19-210ENST00000439048 DNAJC5BQ9UF47 199 aa35.99■■■■□ 3.35
MMS19-210ENST00000439048 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP35.56■■■■□ 3.28
MMS19-210ENST00000439048 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa35.45■■■■□ 3.27
MMS19-210ENST00000439048 CECR2Q9BXF3 1484 aa35.23■■■■□ 3.23
MMS19-210ENST00000439048 SMARCA4P51532 1647 aa34.81■■■■□ 3.16
MMS19-210ENST00000439048 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP34.74■■■■□ 3.15
MMS19-210ENST00000439048 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa34.62■■■■□ 3.13
MMS19-210ENST00000439048 SMARCA2P51531 1590 aa34.62■■■■□ 3.13
MMS19-210ENST00000439048 NCAPD3P42695 1498 aa34.61■■■■□ 3.13
MMS19-210ENST00000439048 HMGXB3Q12766 1538 aa34.5■■■■□ 3.11
MMS19-210ENST00000439048 MROH2BQ7Z745 1585 aa34.49■■■■□ 3.11
MMS19-210ENST00000439048 PEG3Q9GZU2 1588 aa34.45■■■■□ 3.11
MMS19-210ENST00000439048 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP34.38■■■■□ 3.09
MMS19-210ENST00000439048 WIZO95785 1651 aa34.12■■■■□ 3.05
MMS19-210ENST00000439048 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP34.03■■■■□ 3.04
MMS19-210ENST00000439048 NESP48681 1621 aa33.84■■■■□ 3.01
MMS19-210ENST00000439048 ERCC6Q03468 1493 aa33.83■■■■□ 3.01
MMS19-210ENST00000439048 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP33.79■■■■□ 3
MMS19-210ENST00000439048 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa33.78■■■■□ 3
MMS19-210ENST00000439048 CADPSQ9ULU8 1353 aa33.6■■■□□ 2.97
MMS19-210ENST00000439048 PDS5BQ9NTI5 1447 aa33.53■■■□□ 2.96
MMS19-210ENST00000439048 CUX2O14529 1486 aa33.51■■■□□ 2.96
MMS19-210ENST00000439048 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa33.49■■■□□ 2.95
MMS19-210ENST00000439048 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP33.42■■■□□ 2.94
MMS19-210ENST00000439048 CFTRP13569 1480 aa33.37■■■□□ 2.93
MMS19-210ENST00000439048 CCDC88BA6NC98 1476 aa33.34■■■□□ 2.93
MMS19-210ENST00000439048 FANCD2Q9BXW9 1451 aa33.25■■■□□ 2.91
MMS19-210ENST00000439048 CEP164Q9UPV0 1460 aa33.25■■■□□ 2.91
MMS19-210ENST00000439048 MRC2Q9UBG0 1479 aa33.23■■■□□ 2.91
MMS19-210ENST00000439048 PRDM2Q13029 1718 aa33.19■■■□□ 2.9
MMS19-210ENST00000439048 WDR62O43379 1518 aa33.12■■■□□ 2.89
MMS19-210ENST00000439048 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP33.03■■■□□ 2.88
MMS19-210ENST00000439048 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP32.92■■■□□ 2.86
MMS19-210ENST00000439048 TOPBP1Q92547 1522 aa32.69■■■□□ 2.82
MMS19-210ENST00000439048 ABCC8Q09428 1581 aa32.69■■■□□ 2.82
MMS19-210ENST00000439048 DNMBPQ6XZF7 1577 aa32.67■■■□□ 2.82
MMS19-210ENST00000439048 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa32.57■■■□□ 2.8
MMS19-210ENST00000439048 IFT140Q96RY7 1462 aa32.54■■■□□ 2.8
MMS19-210ENST00000439048 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP32.41■■■□□ 2.78
MMS19-210ENST00000439048 CUX1P39880 1505 aa32.39■■■□□ 2.78
MMS19-210ENST00000439048 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP32.38■■■□□ 2.77
MMS19-210ENST00000439048 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP32.36■■■□□ 2.77
MMS19-210ENST00000439048 FGD5Q6ZNL6 1462 aa32.32■■■□□ 2.76
MMS19-210ENST00000439048 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP32.31■■■□□ 2.76
MMS19-210ENST00000439048 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa32.24■■■□□ 2.75
MMS19-210ENST00000439048 SOGA1O94964 1423 aa32.24■■■□□ 2.75
MMS19-210ENST00000439048 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP32.16■■■□□ 2.746e-8■■■■■ 26.8
MMS19-210ENST00000439048 WDR97A6NE52 1622 aa32.13■■■□□ 2.73
MMS19-210ENST00000439048 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP32.12■■■□□ 2.73
MMS19-210ENST00000439048 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa32.09■■■□□ 2.73
MMS19-210ENST00000439048 TOP2BQ02880 1626 aa32.08■■■□□ 2.73
MMS19-210ENST00000439048 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP32.07■■■□□ 2.73
MMS19-210ENST00000439048 SYNJ1O43426 1573 aa32.07■■■□□ 2.72
MMS19-210ENST00000439048 OSCARQ8IYS5 282 aa32.02■■■□□ 2.72
MMS19-210ENST00000439048 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa31.99■■■□□ 2.71
MMS19-210ENST00000439048 CHD1O14646 1710 aa31.92■■■□□ 2.7
MMS19-210ENST00000439048 GRIN2BQ13224 1484 aa31.92■■■□□ 2.7
MMS19-210ENST00000439048 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa31.91■■■□□ 2.7
MMS19-210ENST00000439048 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa31.9■■■□□ 2.7
MMS19-210ENST00000439048 GAPVD1Q14C86 1478 aa31.9■■■□□ 2.7
MMS19-210ENST00000439048 PBRM1Q86U86 1689 aa31.89■■■□□ 2.7
MMS19-210ENST00000439048 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP31.87■■■□□ 2.69
MMS19-210ENST00000439048 FBLN2P98095 1184 aa31.82■■■□□ 2.68
MMS19-210ENST00000439048 SYNJ2O15056 1496 aa31.74■■■□□ 2.67
MMS19-210ENST00000439048 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP31.7■■■□□ 2.67
MMS19-210ENST00000439048 ADAMTS12P58397 1594 aa31.63■■■□□ 2.65
MMS19-210ENST00000439048 ERICH3Q5RHP9 1530 aa31.61■■■□□ 2.65
MMS19-210ENST00000439048 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa31.6■■■□□ 2.65
MMS19-210ENST00000439048 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa31.6■■■□□ 2.65
MMS19-210ENST00000439048 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa31.6■■■□□ 2.65
MMS19-210ENST00000439048 ARHGEF11O15085 1522 aa31.57■■■□□ 2.64
MMS19-210ENST00000439048 CLASP1Q7Z460 1538 aa31.56■■■□□ 2.64
MMS19-210ENST00000439048 FHAD1B1AJZ9 1412 aa31.52■■■□□ 2.64
MMS19-210ENST00000439048 GRIN2AQ12879 1464 aa31.52■■■□□ 2.64
MMS19-210ENST00000439048 TRIM41Q8WV44 630 aa31.5■■■□□ 2.63
MMS19-210ENST00000439048 KIF27Q86VH2 1401 aa31.47■■■□□ 2.63
MMS19-210ENST00000439048 CEP170Q5SW79 1584 aa31.37■■■□□ 2.61
MMS19-210ENST00000439048 NUP160Q12769 1436 aa31.36■■■□□ 2.61
MMS19-210ENST00000439048 CUL7Q14999 1698 aa31.33■■■□□ 2.61
MMS19-210ENST00000439048 ARAP1Q96P48 1450 aa31.3■■■□□ 2.6
MMS19-210ENST00000439048 IGF1RP08069 1367 aa31.3■■■□□ 2.6
MMS19-210ENST00000439048 CYB5RLQ6IPT4 315 aa31.22■■■□□ 2.59
MMS19-210ENST00000439048 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa31.17■■■□□ 2.58
MMS19-210ENST00000439048 SHROOM2Q13796 1616 aa31.16■■■□□ 2.58
MMS19-210ENST00000439048 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa31.14■■■□□ 2.58
MMS19-210ENST00000439048 ERCC6L2Q5T890 1561 aa31.09■■■□□ 2.57
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