Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW43

APH1B, Gamma-secretase subunit APH-1B, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APH1BQ8WW43 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
APH1BQ8WW43 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
APH1BQ8WW43 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
APH1BQ8WW43 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
APH1BQ8WW43 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
APH1BQ8WW43 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
APH1BQ8WW43 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
APH1BQ8WW43 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
APH1BQ8WW43 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
APH1BQ8WW43 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
APH1BQ8WW43 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
APH1BQ8WW43 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
APH1BQ8WW43 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
APH1BQ8WW43 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
APH1BQ8WW43 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
APH1BQ8WW43 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
APH1BQ8WW43 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
APH1BQ8WW43 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
APH1BQ8WW43 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
APH1BQ8WW43 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
APH1BQ8WW43 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
APH1BQ8WW43 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
APH1BQ8WW43 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
APH1BQ8WW43 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
APH1BQ8WW43 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
APH1BQ8WW43 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
APH1BQ8WW43 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
APH1BQ8WW43 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
APH1BQ8WW43 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
APH1BQ8WW43 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
APH1BQ8WW43 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
APH1BQ8WW43 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
APH1BQ8WW43 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
APH1BQ8WW43 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
APH1BQ8WW43 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
APH1BQ8WW43 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
APH1BQ8WW43 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
APH1BQ8WW43 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
APH1BQ8WW43 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
APH1BQ8WW43 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
APH1BQ8WW43 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
APH1BQ8WW43 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
APH1BQ8WW43 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
APH1BQ8WW43 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
APH1BQ8WW43 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
APH1BQ8WW43 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
APH1BQ8WW43 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
APH1BQ8WW43 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
APH1BQ8WW43 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
APH1BQ8WW43 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
APH1BQ8WW43 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
APH1BQ8WW43 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
APH1BQ8WW43 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
APH1BQ8WW43 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
APH1BQ8WW43 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
APH1BQ8WW43 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
APH1BQ8WW43 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
APH1BQ8WW43 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
APH1BQ8WW43 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
APH1BQ8WW43 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
APH1BQ8WW43 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
APH1BQ8WW43 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
APH1BQ8WW43 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
APH1BQ8WW43 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
APH1BQ8WW43 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
APH1BQ8WW43 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
APH1BQ8WW43 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
APH1BQ8WW43 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
APH1BQ8WW43 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
APH1BQ8WW43 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
APH1BQ8WW43 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
APH1BQ8WW43 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
APH1BQ8WW43 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
APH1BQ8WW43 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
APH1BQ8WW43 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
APH1BQ8WW43 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
APH1BQ8WW43 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
APH1BQ8WW43 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
APH1BQ8WW43 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
APH1BQ8WW43 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
APH1BQ8WW43 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
APH1BQ8WW43 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
APH1BQ8WW43 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
APH1BQ8WW43 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
APH1BQ8WW43 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
APH1BQ8WW43 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
APH1BQ8WW43 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
APH1BQ8WW43 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
APH1BQ8WW43 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
APH1BQ8WW43 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
APH1BQ8WW43 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
APH1BQ8WW43 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
APH1BQ8WW43 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
APH1BQ8WW43 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
APH1BQ8WW43 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
APH1BQ8WW43 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
APH1BQ8WW43 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
APH1BQ8WW43 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
APH1BQ8WW43 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
APH1BQ8WW43 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms