Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9N7

LRRC57, Leucine-rich repeat-containing protein 57, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC57Q8N9N7 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRC57Q8N9N7 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRC57Q8N9N7 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRC57Q8N9N7 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRC57Q8N9N7 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRC57Q8N9N7 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRC57Q8N9N7 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRC57Q8N9N7 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRC57Q8N9N7 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRC57Q8N9N7 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRRC57Q8N9N7 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRRC57Q8N9N7 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
LRRC57Q8N9N7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRRC57Q8N9N7 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRRC57Q8N9N7 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRRC57Q8N9N7 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRRC57Q8N9N7 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRRC57Q8N9N7 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRRC57Q8N9N7 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRRC57Q8N9N7 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRRC57Q8N9N7 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRRC57Q8N9N7 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRRC57Q8N9N7 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRRC57Q8N9N7 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRRC57Q8N9N7 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRRC57Q8N9N7 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRRC57Q8N9N7 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LRRC57Q8N9N7 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LRRC57Q8N9N7 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
LRRC57Q8N9N7 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
LRRC57Q8N9N7 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
LRRC57Q8N9N7 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LRRC57Q8N9N7 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRRC57Q8N9N7 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRRC57Q8N9N7 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRRC57Q8N9N7 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRRC57Q8N9N7 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRC57Q8N9N7 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRC57Q8N9N7 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRC57Q8N9N7 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRC57Q8N9N7 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRC57Q8N9N7 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRC57Q8N9N7 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRC57Q8N9N7 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRC57Q8N9N7 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRC57Q8N9N7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRC57Q8N9N7 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRC57Q8N9N7 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRC57Q8N9N7 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRC57Q8N9N7 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRC57Q8N9N7 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRC57Q8N9N7 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRC57Q8N9N7 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRC57Q8N9N7 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRC57Q8N9N7 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRC57Q8N9N7 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRC57Q8N9N7 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRC57Q8N9N7 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
LRRC57Q8N9N7 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRRC57Q8N9N7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRRC57Q8N9N7 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRRC57Q8N9N7 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRRC57Q8N9N7 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRRC57Q8N9N7 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRRC57Q8N9N7 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRRC57Q8N9N7 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRC57Q8N9N7 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRC57Q8N9N7 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRC57Q8N9N7 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRC57Q8N9N7 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRC57Q8N9N7 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRC57Q8N9N7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRC57Q8N9N7 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRC57Q8N9N7 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRC57Q8N9N7 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRC57Q8N9N7 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRC57Q8N9N7 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRC57Q8N9N7 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRC57Q8N9N7 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRC57Q8N9N7 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRC57Q8N9N7 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRC57Q8N9N7 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRC57Q8N9N7 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRC57Q8N9N7 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRC57Q8N9N7 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRC57Q8N9N7 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRC57Q8N9N7 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRC57Q8N9N7 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRC57Q8N9N7 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRC57Q8N9N7 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRC57Q8N9N7 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRC57Q8N9N7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRC57Q8N9N7 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRC57Q8N9N7 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRC57Q8N9N7 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRC57Q8N9N7 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRC57Q8N9N7 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRC57Q8N9N7 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRC57Q8N9N7 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRC57Q8N9N7 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms