Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1G2

CMTR1, Cap-specific mRNA (nucleoside-2'-O-)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTR1Q8N1G2 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
CMTR1Q8N1G2 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
CMTR1Q8N1G2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CMTR1Q8N1G2 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CMTR1Q8N1G2 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CMTR1Q8N1G2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CMTR1Q8N1G2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CMTR1Q8N1G2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CMTR1Q8N1G2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CMTR1Q8N1G2 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CMTR1Q8N1G2 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CMTR1Q8N1G2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CMTR1Q8N1G2 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CMTR1Q8N1G2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
CMTR1Q8N1G2 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CMTR1Q8N1G2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CMTR1Q8N1G2 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CMTR1Q8N1G2 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CMTR1Q8N1G2 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CMTR1Q8N1G2 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
CMTR1Q8N1G2 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CMTR1Q8N1G2 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CMTR1Q8N1G2 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CMTR1Q8N1G2 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CMTR1Q8N1G2 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CMTR1Q8N1G2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CMTR1Q8N1G2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CMTR1Q8N1G2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CMTR1Q8N1G2 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CMTR1Q8N1G2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CMTR1Q8N1G2 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CMTR1Q8N1G2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CMTR1Q8N1G2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
CMTR1Q8N1G2 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CMTR1Q8N1G2 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CMTR1Q8N1G2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CMTR1Q8N1G2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CMTR1Q8N1G2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CMTR1Q8N1G2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CMTR1Q8N1G2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CMTR1Q8N1G2 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CMTR1Q8N1G2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CMTR1Q8N1G2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CMTR1Q8N1G2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CMTR1Q8N1G2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CMTR1Q8N1G2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CMTR1Q8N1G2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CMTR1Q8N1G2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CMTR1Q8N1G2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CMTR1Q8N1G2 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CMTR1Q8N1G2 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CMTR1Q8N1G2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
CMTR1Q8N1G2 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CMTR1Q8N1G2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CMTR1Q8N1G2 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CMTR1Q8N1G2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CMTR1Q8N1G2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CMTR1Q8N1G2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CMTR1Q8N1G2 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CMTR1Q8N1G2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CMTR1Q8N1G2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CMTR1Q8N1G2 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CMTR1Q8N1G2 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CMTR1Q8N1G2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CMTR1Q8N1G2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CMTR1Q8N1G2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CMTR1Q8N1G2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CMTR1Q8N1G2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CMTR1Q8N1G2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CMTR1Q8N1G2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CMTR1Q8N1G2 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CMTR1Q8N1G2 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CMTR1Q8N1G2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CMTR1Q8N1G2 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CMTR1Q8N1G2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CMTR1Q8N1G2 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CMTR1Q8N1G2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CMTR1Q8N1G2 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CMTR1Q8N1G2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CMTR1Q8N1G2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CMTR1Q8N1G2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CMTR1Q8N1G2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CMTR1Q8N1G2 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CMTR1Q8N1G2 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CMTR1Q8N1G2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CMTR1Q8N1G2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CMTR1Q8N1G2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CMTR1Q8N1G2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CMTR1Q8N1G2 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CMTR1Q8N1G2 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CMTR1Q8N1G2 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.54■■■□□ 2
CMTR1Q8N1G2 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CMTR1Q8N1G2 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CMTR1Q8N1G2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CMTR1Q8N1G2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CMTR1Q8N1G2 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CMTR1Q8N1G2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CMTR1Q8N1G2 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
CMTR1Q8N1G2 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
CMTR1Q8N1G2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms