Protein–RNA interactions for Protein: Q8IX30

SCUBE3, Signal peptide, CUB and EGF-like domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCUBE3Q8IX30 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SCUBE3Q8IX30 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SCUBE3Q8IX30 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SCUBE3Q8IX30 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SCUBE3Q8IX30 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SCUBE3Q8IX30 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SCUBE3Q8IX30 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SCUBE3Q8IX30 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCUBE3Q8IX30 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCUBE3Q8IX30 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCUBE3Q8IX30 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SCUBE3Q8IX30 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCUBE3Q8IX30 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCUBE3Q8IX30 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCUBE3Q8IX30 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCUBE3Q8IX30 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SCUBE3Q8IX30 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SCUBE3Q8IX30 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SCUBE3Q8IX30 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SCUBE3Q8IX30 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
SCUBE3Q8IX30 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SCUBE3Q8IX30 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SCUBE3Q8IX30 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SCUBE3Q8IX30 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SCUBE3Q8IX30 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCUBE3Q8IX30 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCUBE3Q8IX30 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCUBE3Q8IX30 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCUBE3Q8IX30 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCUBE3Q8IX30 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCUBE3Q8IX30 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCUBE3Q8IX30 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SCUBE3Q8IX30 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCUBE3Q8IX30 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCUBE3Q8IX30 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCUBE3Q8IX30 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCUBE3Q8IX30 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCUBE3Q8IX30 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCUBE3Q8IX30 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCUBE3Q8IX30 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCUBE3Q8IX30 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCUBE3Q8IX30 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCUBE3Q8IX30 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCUBE3Q8IX30 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCUBE3Q8IX30 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCUBE3Q8IX30 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCUBE3Q8IX30 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCUBE3Q8IX30 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCUBE3Q8IX30 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCUBE3Q8IX30 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCUBE3Q8IX30 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCUBE3Q8IX30 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCUBE3Q8IX30 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SCUBE3Q8IX30 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCUBE3Q8IX30 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCUBE3Q8IX30 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCUBE3Q8IX30 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCUBE3Q8IX30 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCUBE3Q8IX30 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCUBE3Q8IX30 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCUBE3Q8IX30 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCUBE3Q8IX30 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCUBE3Q8IX30 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCUBE3Q8IX30 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCUBE3Q8IX30 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCUBE3Q8IX30 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SCUBE3Q8IX30 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCUBE3Q8IX30 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCUBE3Q8IX30 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCUBE3Q8IX30 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCUBE3Q8IX30 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SCUBE3Q8IX30 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCUBE3Q8IX30 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCUBE3Q8IX30 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCUBE3Q8IX30 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCUBE3Q8IX30 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCUBE3Q8IX30 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SCUBE3Q8IX30 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCUBE3Q8IX30 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCUBE3Q8IX30 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCUBE3Q8IX30 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCUBE3Q8IX30 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCUBE3Q8IX30 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCUBE3Q8IX30 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCUBE3Q8IX30 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SCUBE3Q8IX30 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCUBE3Q8IX30 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCUBE3Q8IX30 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCUBE3Q8IX30 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCUBE3Q8IX30 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCUBE3Q8IX30 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCUBE3Q8IX30 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SCUBE3Q8IX30 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SCUBE3Q8IX30 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SCUBE3Q8IX30 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SCUBE3Q8IX30 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SCUBE3Q8IX30 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SCUBE3Q8IX30 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SCUBE3Q8IX30 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SCUBE3Q8IX30 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 253.2 ms