Protein–RNA interactions for Protein: Q86YW5

TREML1, Trem-like transcript 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREML1Q86YW5 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TREML1Q86YW5 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TREML1Q86YW5 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TREML1Q86YW5 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TREML1Q86YW5 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TREML1Q86YW5 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TREML1Q86YW5 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TREML1Q86YW5 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TREML1Q86YW5 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TREML1Q86YW5 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TREML1Q86YW5 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TREML1Q86YW5 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TREML1Q86YW5 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TREML1Q86YW5 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TREML1Q86YW5 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TREML1Q86YW5 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TREML1Q86YW5 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TREML1Q86YW5 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TREML1Q86YW5 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TREML1Q86YW5 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TREML1Q86YW5 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TREML1Q86YW5 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TREML1Q86YW5 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TREML1Q86YW5 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TREML1Q86YW5 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TREML1Q86YW5 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TREML1Q86YW5 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TREML1Q86YW5 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TREML1Q86YW5 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TREML1Q86YW5 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TREML1Q86YW5 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TREML1Q86YW5 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TREML1Q86YW5 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TREML1Q86YW5 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TREML1Q86YW5 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TREML1Q86YW5 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TREML1Q86YW5 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TREML1Q86YW5 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TREML1Q86YW5 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TREML1Q86YW5 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TREML1Q86YW5 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TREML1Q86YW5 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TREML1Q86YW5 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TREML1Q86YW5 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TREML1Q86YW5 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TREML1Q86YW5 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TREML1Q86YW5 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TREML1Q86YW5 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TREML1Q86YW5 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TREML1Q86YW5 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TREML1Q86YW5 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TREML1Q86YW5 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TREML1Q86YW5 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TREML1Q86YW5 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TREML1Q86YW5 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TREML1Q86YW5 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TREML1Q86YW5 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TREML1Q86YW5 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TREML1Q86YW5 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TREML1Q86YW5 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TREML1Q86YW5 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TREML1Q86YW5 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TREML1Q86YW5 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TREML1Q86YW5 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TREML1Q86YW5 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TREML1Q86YW5 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TREML1Q86YW5 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TREML1Q86YW5 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TREML1Q86YW5 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TREML1Q86YW5 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TREML1Q86YW5 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TREML1Q86YW5 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TREML1Q86YW5 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TREML1Q86YW5 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TREML1Q86YW5 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TREML1Q86YW5 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TREML1Q86YW5 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TREML1Q86YW5 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TREML1Q86YW5 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TREML1Q86YW5 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TREML1Q86YW5 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TREML1Q86YW5 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TREML1Q86YW5 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TREML1Q86YW5 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TREML1Q86YW5 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TREML1Q86YW5 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TREML1Q86YW5 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TREML1Q86YW5 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TREML1Q86YW5 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TREML1Q86YW5 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TREML1Q86YW5 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TREML1Q86YW5 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TREML1Q86YW5 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TREML1Q86YW5 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TREML1Q86YW5 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TREML1Q86YW5 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TREML1Q86YW5 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TREML1Q86YW5 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TREML1Q86YW5 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TREML1Q86YW5 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms