Protein–RNA interactions for Protein: Q6TFL3

CCDC171, Coiled-coil domain-containing protein 171, humanhuman

Predictions only

Length 1,326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC171Q6TFL3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC171Q6TFL3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC171Q6TFL3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC171Q6TFL3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC171Q6TFL3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC171Q6TFL3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC171Q6TFL3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC171Q6TFL3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC171Q6TFL3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC171Q6TFL3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC171Q6TFL3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC171Q6TFL3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC171Q6TFL3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC171Q6TFL3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC171Q6TFL3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC171Q6TFL3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC171Q6TFL3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC171Q6TFL3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC171Q6TFL3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC171Q6TFL3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC171Q6TFL3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC171Q6TFL3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC171Q6TFL3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC171Q6TFL3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC171Q6TFL3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC171Q6TFL3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC171Q6TFL3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC171Q6TFL3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC171Q6TFL3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC171Q6TFL3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC171Q6TFL3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC171Q6TFL3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC171Q6TFL3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC171Q6TFL3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC171Q6TFL3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC171Q6TFL3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC171Q6TFL3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC171Q6TFL3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC171Q6TFL3 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC171Q6TFL3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC171Q6TFL3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC171Q6TFL3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC171Q6TFL3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC171Q6TFL3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC171Q6TFL3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC171Q6TFL3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC171Q6TFL3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC171Q6TFL3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC171Q6TFL3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC171Q6TFL3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC171Q6TFL3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC171Q6TFL3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC171Q6TFL3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC171Q6TFL3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC171Q6TFL3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC171Q6TFL3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC171Q6TFL3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC171Q6TFL3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC171Q6TFL3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC171Q6TFL3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC171Q6TFL3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC171Q6TFL3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC171Q6TFL3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
CCDC171Q6TFL3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC171Q6TFL3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC171Q6TFL3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC171Q6TFL3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC171Q6TFL3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC171Q6TFL3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC171Q6TFL3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC171Q6TFL3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC171Q6TFL3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC171Q6TFL3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC171Q6TFL3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC171Q6TFL3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC171Q6TFL3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC171Q6TFL3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC171Q6TFL3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC171Q6TFL3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC171Q6TFL3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC171Q6TFL3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC171Q6TFL3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC171Q6TFL3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC171Q6TFL3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC171Q6TFL3 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC171Q6TFL3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC171Q6TFL3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC171Q6TFL3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC171Q6TFL3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC171Q6TFL3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC171Q6TFL3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC171Q6TFL3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC171Q6TFL3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC171Q6TFL3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC171Q6TFL3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC171Q6TFL3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC171Q6TFL3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC171Q6TFL3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC171Q6TFL3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC171Q6TFL3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms