Protein–RNA interactions for Protein: Q658N2

WSCD1, WSC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WSCD1Q658N2 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
WSCD1Q658N2 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
WSCD1Q658N2 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
WSCD1Q658N2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
WSCD1Q658N2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
WSCD1Q658N2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
WSCD1Q658N2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
WSCD1Q658N2 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
WSCD1Q658N2 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
WSCD1Q658N2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
WSCD1Q658N2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
WSCD1Q658N2 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
WSCD1Q658N2 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
WSCD1Q658N2 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
WSCD1Q658N2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
WSCD1Q658N2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
WSCD1Q658N2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
WSCD1Q658N2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
WSCD1Q658N2 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
WSCD1Q658N2 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
WSCD1Q658N2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
WSCD1Q658N2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
WSCD1Q658N2 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
WSCD1Q658N2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
WSCD1Q658N2 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
WSCD1Q658N2 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
WSCD1Q658N2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
WSCD1Q658N2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
WSCD1Q658N2 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
WSCD1Q658N2 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
WSCD1Q658N2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
WSCD1Q658N2 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
WSCD1Q658N2 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
WSCD1Q658N2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
WSCD1Q658N2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
WSCD1Q658N2 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
WSCD1Q658N2 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
WSCD1Q658N2 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
WSCD1Q658N2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
WSCD1Q658N2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
WSCD1Q658N2 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
WSCD1Q658N2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
WSCD1Q658N2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
WSCD1Q658N2 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
WSCD1Q658N2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
WSCD1Q658N2 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
WSCD1Q658N2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
WSCD1Q658N2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
WSCD1Q658N2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
WSCD1Q658N2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
WSCD1Q658N2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
WSCD1Q658N2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
WSCD1Q658N2 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
WSCD1Q658N2 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
WSCD1Q658N2 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
WSCD1Q658N2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
WSCD1Q658N2 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
WSCD1Q658N2 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
WSCD1Q658N2 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
WSCD1Q658N2 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
WSCD1Q658N2 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
WSCD1Q658N2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
WSCD1Q658N2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
WSCD1Q658N2 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
WSCD1Q658N2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
WSCD1Q658N2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
WSCD1Q658N2 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
WSCD1Q658N2 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
WSCD1Q658N2 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
WSCD1Q658N2 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
WSCD1Q658N2 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
WSCD1Q658N2 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
WSCD1Q658N2 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
WSCD1Q658N2 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
WSCD1Q658N2 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
WSCD1Q658N2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
WSCD1Q658N2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
WSCD1Q658N2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
WSCD1Q658N2 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
WSCD1Q658N2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
WSCD1Q658N2 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
WSCD1Q658N2 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
WSCD1Q658N2 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
WSCD1Q658N2 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
WSCD1Q658N2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
WSCD1Q658N2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
WSCD1Q658N2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
WSCD1Q658N2 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
WSCD1Q658N2 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
WSCD1Q658N2 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
WSCD1Q658N2 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
WSCD1Q658N2 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
WSCD1Q658N2 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
WSCD1Q658N2 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
WSCD1Q658N2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
WSCD1Q658N2 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
WSCD1Q658N2 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
WSCD1Q658N2 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
WSCD1Q658N2 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
WSCD1Q658N2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 140.6 ms