Protein–RNA interactions for Protein: Q5TDP6

LGSN, Lengsin, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGSNQ5TDP6 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LGSNQ5TDP6 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LGSNQ5TDP6 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LGSNQ5TDP6 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
LGSNQ5TDP6 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LGSNQ5TDP6 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LGSNQ5TDP6 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LGSNQ5TDP6 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LGSNQ5TDP6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LGSNQ5TDP6 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LGSNQ5TDP6 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LGSNQ5TDP6 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LGSNQ5TDP6 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
LGSNQ5TDP6 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LGSNQ5TDP6 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LGSNQ5TDP6 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LGSNQ5TDP6 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LGSNQ5TDP6 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LGSNQ5TDP6 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LGSNQ5TDP6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LGSNQ5TDP6 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LGSNQ5TDP6 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LGSNQ5TDP6 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LGSNQ5TDP6 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LGSNQ5TDP6 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LGSNQ5TDP6 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LGSNQ5TDP6 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LGSNQ5TDP6 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LGSNQ5TDP6 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LGSNQ5TDP6 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LGSNQ5TDP6 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LGSNQ5TDP6 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LGSNQ5TDP6 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LGSNQ5TDP6 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LGSNQ5TDP6 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LGSNQ5TDP6 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LGSNQ5TDP6 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LGSNQ5TDP6 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LGSNQ5TDP6 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LGSNQ5TDP6 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LGSNQ5TDP6 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LGSNQ5TDP6 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LGSNQ5TDP6 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LGSNQ5TDP6 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LGSNQ5TDP6 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LGSNQ5TDP6 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LGSNQ5TDP6 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LGSNQ5TDP6 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LGSNQ5TDP6 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LGSNQ5TDP6 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LGSNQ5TDP6 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LGSNQ5TDP6 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LGSNQ5TDP6 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
LGSNQ5TDP6 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LGSNQ5TDP6 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LGSNQ5TDP6 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LGSNQ5TDP6 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LGSNQ5TDP6 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LGSNQ5TDP6 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LGSNQ5TDP6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LGSNQ5TDP6 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LGSNQ5TDP6 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LGSNQ5TDP6 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LGSNQ5TDP6 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LGSNQ5TDP6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LGSNQ5TDP6 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LGSNQ5TDP6 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LGSNQ5TDP6 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LGSNQ5TDP6 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LGSNQ5TDP6 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LGSNQ5TDP6 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LGSNQ5TDP6 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LGSNQ5TDP6 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LGSNQ5TDP6 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LGSNQ5TDP6 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LGSNQ5TDP6 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LGSNQ5TDP6 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
LGSNQ5TDP6 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
LGSNQ5TDP6 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
LGSNQ5TDP6 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
LGSNQ5TDP6 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LGSNQ5TDP6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LGSNQ5TDP6 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LGSNQ5TDP6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LGSNQ5TDP6 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LGSNQ5TDP6 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LGSNQ5TDP6 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LGSNQ5TDP6 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LGSNQ5TDP6 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LGSNQ5TDP6 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LGSNQ5TDP6 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LGSNQ5TDP6 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LGSNQ5TDP6 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LGSNQ5TDP6 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LGSNQ5TDP6 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LGSNQ5TDP6 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LGSNQ5TDP6 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LGSNQ5TDP6 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LGSNQ5TDP6 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LGSNQ5TDP6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms