Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2D3

OTUD3, OTU domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD3Q5T2D3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
OTUD3Q5T2D3 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
OTUD3Q5T2D3 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
OTUD3Q5T2D3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
OTUD3Q5T2D3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
OTUD3Q5T2D3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
OTUD3Q5T2D3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
OTUD3Q5T2D3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
OTUD3Q5T2D3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
OTUD3Q5T2D3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
OTUD3Q5T2D3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
OTUD3Q5T2D3 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
OTUD3Q5T2D3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
OTUD3Q5T2D3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
OTUD3Q5T2D3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
OTUD3Q5T2D3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
OTUD3Q5T2D3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
OTUD3Q5T2D3 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
OTUD3Q5T2D3 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
OTUD3Q5T2D3 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
OTUD3Q5T2D3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
OTUD3Q5T2D3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
OTUD3Q5T2D3 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
OTUD3Q5T2D3 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
OTUD3Q5T2D3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
OTUD3Q5T2D3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
OTUD3Q5T2D3 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
OTUD3Q5T2D3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
OTUD3Q5T2D3 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
OTUD3Q5T2D3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
OTUD3Q5T2D3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
OTUD3Q5T2D3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
OTUD3Q5T2D3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
OTUD3Q5T2D3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
OTUD3Q5T2D3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
OTUD3Q5T2D3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
OTUD3Q5T2D3 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
OTUD3Q5T2D3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
OTUD3Q5T2D3 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
OTUD3Q5T2D3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
OTUD3Q5T2D3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
OTUD3Q5T2D3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
OTUD3Q5T2D3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
OTUD3Q5T2D3 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
OTUD3Q5T2D3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
OTUD3Q5T2D3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
OTUD3Q5T2D3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
OTUD3Q5T2D3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
OTUD3Q5T2D3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
OTUD3Q5T2D3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
OTUD3Q5T2D3 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
OTUD3Q5T2D3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
OTUD3Q5T2D3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
OTUD3Q5T2D3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
OTUD3Q5T2D3 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
OTUD3Q5T2D3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
OTUD3Q5T2D3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
OTUD3Q5T2D3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
OTUD3Q5T2D3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
OTUD3Q5T2D3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
OTUD3Q5T2D3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
OTUD3Q5T2D3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
OTUD3Q5T2D3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
OTUD3Q5T2D3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
OTUD3Q5T2D3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
OTUD3Q5T2D3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
OTUD3Q5T2D3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
OTUD3Q5T2D3 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
OTUD3Q5T2D3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
OTUD3Q5T2D3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
OTUD3Q5T2D3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
OTUD3Q5T2D3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
OTUD3Q5T2D3 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
OTUD3Q5T2D3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
OTUD3Q5T2D3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
OTUD3Q5T2D3 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
OTUD3Q5T2D3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
OTUD3Q5T2D3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
OTUD3Q5T2D3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
OTUD3Q5T2D3 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
OTUD3Q5T2D3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
OTUD3Q5T2D3 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
OTUD3Q5T2D3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
OTUD3Q5T2D3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
OTUD3Q5T2D3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
OTUD3Q5T2D3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
OTUD3Q5T2D3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
OTUD3Q5T2D3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
OTUD3Q5T2D3 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
OTUD3Q5T2D3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
OTUD3Q5T2D3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
OTUD3Q5T2D3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
OTUD3Q5T2D3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
OTUD3Q5T2D3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
OTUD3Q5T2D3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
OTUD3Q5T2D3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
OTUD3Q5T2D3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
OTUD3Q5T2D3 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
OTUD3Q5T2D3 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
OTUD3Q5T2D3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms