Protein–RNA interactions for Protein: Q5QGS0

NEXMIF, Neurite extension and migration factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,516 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEXMIFQ5QGS0 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC34.27■■■■□ 3.08
NEXMIFQ5QGS0 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
NEXMIFQ5QGS0 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
NEXMIFQ5QGS0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
NEXMIFQ5QGS0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
NEXMIFQ5QGS0 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
NEXMIFQ5QGS0 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
NEXMIFQ5QGS0 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
NEXMIFQ5QGS0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC34.23■■■■□ 3.07
NEXMIFQ5QGS0 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
NEXMIFQ5QGS0 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
NEXMIFQ5QGS0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
NEXMIFQ5QGS0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
NEXMIFQ5QGS0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
NEXMIFQ5QGS0 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
NEXMIFQ5QGS0 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
NEXMIFQ5QGS0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
NEXMIFQ5QGS0 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
NEXMIFQ5QGS0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
NEXMIFQ5QGS0 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
NEXMIFQ5QGS0 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC34.21■■■■□ 3.07
NEXMIFQ5QGS0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
NEXMIFQ5QGS0 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
NEXMIFQ5QGS0 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC34.2■■■■□ 3.07
NEXMIFQ5QGS0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
NEXMIFQ5QGS0 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.06
NEXMIFQ5QGS0 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
NEXMIFQ5QGS0 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
NEXMIFQ5QGS0 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
NEXMIFQ5QGS0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
NEXMIFQ5QGS0 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC34.19■■■■□ 3.06
NEXMIFQ5QGS0 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
NEXMIFQ5QGS0 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
NEXMIFQ5QGS0 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
NEXMIFQ5QGS0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
NEXMIFQ5QGS0 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
NEXMIFQ5QGS0 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
NEXMIFQ5QGS0 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
NEXMIFQ5QGS0 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
NEXMIFQ5QGS0 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
NEXMIFQ5QGS0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
NEXMIFQ5QGS0 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
NEXMIFQ5QGS0 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
NEXMIFQ5QGS0 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
NEXMIFQ5QGS0 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
NEXMIFQ5QGS0 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
NEXMIFQ5QGS0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
NEXMIFQ5QGS0 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
NEXMIFQ5QGS0 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
NEXMIFQ5QGS0 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC34.14■■■■□ 3.06
NEXMIFQ5QGS0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
NEXMIFQ5QGS0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
NEXMIFQ5QGS0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
NEXMIFQ5QGS0 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
NEXMIFQ5QGS0 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
NEXMIFQ5QGS0 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC34.14■■■■□ 3.06
NEXMIFQ5QGS0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
NEXMIFQ5QGS0 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC34.13■■■■□ 3.05
NEXMIFQ5QGS0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
NEXMIFQ5QGS0 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC34.13■■■■□ 3.05
NEXMIFQ5QGS0 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
NEXMIFQ5QGS0 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
NEXMIFQ5QGS0 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
NEXMIFQ5QGS0 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
NEXMIFQ5QGS0 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
NEXMIFQ5QGS0 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
NEXMIFQ5QGS0 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
NEXMIFQ5QGS0 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
NEXMIFQ5QGS0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
NEXMIFQ5QGS0 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC34.12■■■■□ 3.05
NEXMIFQ5QGS0 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC34.12■■■■□ 3.05
NEXMIFQ5QGS0 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
NEXMIFQ5QGS0 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
NEXMIFQ5QGS0 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
NEXMIFQ5QGS0 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC34.1■■■■□ 3.05
NEXMIFQ5QGS0 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
NEXMIFQ5QGS0 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
NEXMIFQ5QGS0 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
NEXMIFQ5QGS0 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
NEXMIFQ5QGS0 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
NEXMIFQ5QGS0 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
NEXMIFQ5QGS0 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
NEXMIFQ5QGS0 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
NEXMIFQ5QGS0 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC34.09■■■■□ 3.05
NEXMIFQ5QGS0 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
NEXMIFQ5QGS0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
NEXMIFQ5QGS0 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
NEXMIFQ5QGS0 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
NEXMIFQ5QGS0 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
NEXMIFQ5QGS0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
NEXMIFQ5QGS0 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
NEXMIFQ5QGS0 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
NEXMIFQ5QGS0 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
NEXMIFQ5QGS0 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
NEXMIFQ5QGS0 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC34.08■■■■□ 3.05
NEXMIFQ5QGS0 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC34.07■■■■□ 3.04
NEXMIFQ5QGS0 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
NEXMIFQ5QGS0 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
NEXMIFQ5QGS0 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
NEXMIFQ5QGS0 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms