Protein–RNA interactions for Protein: Q5M9N0

CCDC158, Coiled-coil domain-containing protein 158, humanhuman

Predictions only

Length 1,113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC158Q5M9N0 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC158Q5M9N0 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC158Q5M9N0 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC158Q5M9N0 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC158Q5M9N0 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC158Q5M9N0 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC158Q5M9N0 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC158Q5M9N0 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC158Q5M9N0 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC158Q5M9N0 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC158Q5M9N0 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC158Q5M9N0 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC158Q5M9N0 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC158Q5M9N0 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC158Q5M9N0 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC158Q5M9N0 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC158Q5M9N0 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC158Q5M9N0 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC158Q5M9N0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC158Q5M9N0 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC158Q5M9N0 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC158Q5M9N0 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC158Q5M9N0 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC158Q5M9N0 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC158Q5M9N0 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC158Q5M9N0 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC158Q5M9N0 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC158Q5M9N0 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC158Q5M9N0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC158Q5M9N0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC158Q5M9N0 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC158Q5M9N0 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC158Q5M9N0 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC158Q5M9N0 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC158Q5M9N0 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC29■■■□□ 2.23
CCDC158Q5M9N0 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC158Q5M9N0 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC158Q5M9N0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC158Q5M9N0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC158Q5M9N0 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC158Q5M9N0 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC158Q5M9N0 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC158Q5M9N0 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC158Q5M9N0 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC158Q5M9N0 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC158Q5M9N0 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC158Q5M9N0 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC158Q5M9N0 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC158Q5M9N0 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC158Q5M9N0 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC158Q5M9N0 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC158Q5M9N0 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC158Q5M9N0 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC158Q5M9N0 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC158Q5M9N0 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC158Q5M9N0 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC158Q5M9N0 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC158Q5M9N0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC158Q5M9N0 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC158Q5M9N0 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC158Q5M9N0 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC158Q5M9N0 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC158Q5M9N0 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC158Q5M9N0 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC158Q5M9N0 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CCDC158Q5M9N0 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CCDC158Q5M9N0 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CCDC158Q5M9N0 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CCDC158Q5M9N0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CCDC158Q5M9N0 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CCDC158Q5M9N0 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC158Q5M9N0 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC158Q5M9N0 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC158Q5M9N0 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC158Q5M9N0 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC158Q5M9N0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC158Q5M9N0 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC158Q5M9N0 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC158Q5M9N0 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC158Q5M9N0 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC158Q5M9N0 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC158Q5M9N0 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC158Q5M9N0 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC158Q5M9N0 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC158Q5M9N0 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC158Q5M9N0 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC158Q5M9N0 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC158Q5M9N0 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC158Q5M9N0 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC158Q5M9N0 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC158Q5M9N0 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC158Q5M9N0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC158Q5M9N0 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC158Q5M9N0 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC158Q5M9N0 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC158Q5M9N0 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC158Q5M9N0 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC158Q5M9N0 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC158Q5M9N0 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC158Q5M9N0 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms