Protein–RNA interactions for Protein: Q52LC2

ATP6AP1L, V-type proton ATPase subunit S1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1LQ52LC2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP6AP1LQ52LC2 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP6AP1LQ52LC2 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP6AP1LQ52LC2 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP6AP1LQ52LC2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP6AP1LQ52LC2 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP6AP1LQ52LC2 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP6AP1LQ52LC2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP6AP1LQ52LC2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP6AP1LQ52LC2 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP6AP1LQ52LC2 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP6AP1LQ52LC2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP6AP1LQ52LC2 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP6AP1LQ52LC2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP6AP1LQ52LC2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP6AP1LQ52LC2 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP6AP1LQ52LC2 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP6AP1LQ52LC2 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP6AP1LQ52LC2 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP6AP1LQ52LC2 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP6AP1LQ52LC2 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP6AP1LQ52LC2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP6AP1LQ52LC2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP6AP1LQ52LC2 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP6AP1LQ52LC2 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP6AP1LQ52LC2 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP6AP1LQ52LC2 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP6AP1LQ52LC2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP6AP1LQ52LC2 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP6AP1LQ52LC2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP6AP1LQ52LC2 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP6AP1LQ52LC2 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP6AP1LQ52LC2 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP6AP1LQ52LC2 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP6AP1LQ52LC2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP6AP1LQ52LC2 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP6AP1LQ52LC2 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP6AP1LQ52LC2 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP6AP1LQ52LC2 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP6AP1LQ52LC2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP6AP1LQ52LC2 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP6AP1LQ52LC2 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP6AP1LQ52LC2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP6AP1LQ52LC2 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP6AP1LQ52LC2 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP6AP1LQ52LC2 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP6AP1LQ52LC2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP6AP1LQ52LC2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP6AP1LQ52LC2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP6AP1LQ52LC2 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP6AP1LQ52LC2 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP6AP1LQ52LC2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP6AP1LQ52LC2 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP6AP1LQ52LC2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP6AP1LQ52LC2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP6AP1LQ52LC2 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP6AP1LQ52LC2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP6AP1LQ52LC2 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP6AP1LQ52LC2 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP6AP1LQ52LC2 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP6AP1LQ52LC2 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP6AP1LQ52LC2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP6AP1LQ52LC2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP6AP1LQ52LC2 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP6AP1LQ52LC2 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP6AP1LQ52LC2 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP6AP1LQ52LC2 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP6AP1LQ52LC2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP6AP1LQ52LC2 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP6AP1LQ52LC2 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP6AP1LQ52LC2 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP6AP1LQ52LC2 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP6AP1LQ52LC2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP6AP1LQ52LC2 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP6AP1LQ52LC2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP6AP1LQ52LC2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP6AP1LQ52LC2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP6AP1LQ52LC2 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP6AP1LQ52LC2 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP6AP1LQ52LC2 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP6AP1LQ52LC2 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP6AP1LQ52LC2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP6AP1LQ52LC2 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP6AP1LQ52LC2 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP6AP1LQ52LC2 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP6AP1LQ52LC2 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP6AP1LQ52LC2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP6AP1LQ52LC2 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP6AP1LQ52LC2 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP6AP1LQ52LC2 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP6AP1LQ52LC2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP6AP1LQ52LC2 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP6AP1LQ52LC2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP6AP1LQ52LC2 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP6AP1LQ52LC2 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP6AP1LQ52LC2 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP6AP1LQ52LC2 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP6AP1LQ52LC2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP6AP1LQ52LC2 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP6AP1LQ52LC2 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms