Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZCM7

TUBB8, Tubulin beta-8 chain, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB8Q3ZCM7 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TUBB8Q3ZCM7 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TUBB8Q3ZCM7 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TUBB8Q3ZCM7 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TUBB8Q3ZCM7 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TUBB8Q3ZCM7 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TUBB8Q3ZCM7 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TUBB8Q3ZCM7 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TUBB8Q3ZCM7 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TUBB8Q3ZCM7 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TUBB8Q3ZCM7 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TUBB8Q3ZCM7 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TUBB8Q3ZCM7 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TUBB8Q3ZCM7 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TUBB8Q3ZCM7 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TUBB8Q3ZCM7 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TUBB8Q3ZCM7 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TUBB8Q3ZCM7 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TUBB8Q3ZCM7 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TUBB8Q3ZCM7 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TUBB8Q3ZCM7 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TUBB8Q3ZCM7 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TUBB8Q3ZCM7 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TUBB8Q3ZCM7 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TUBB8Q3ZCM7 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TUBB8Q3ZCM7 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TUBB8Q3ZCM7 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TUBB8Q3ZCM7 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TUBB8Q3ZCM7 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TUBB8Q3ZCM7 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TUBB8Q3ZCM7 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TUBB8Q3ZCM7 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TUBB8Q3ZCM7 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TUBB8Q3ZCM7 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TUBB8Q3ZCM7 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TUBB8Q3ZCM7 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TUBB8Q3ZCM7 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TUBB8Q3ZCM7 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TUBB8Q3ZCM7 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TUBB8Q3ZCM7 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TUBB8Q3ZCM7 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TUBB8Q3ZCM7 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TUBB8Q3ZCM7 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TUBB8Q3ZCM7 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TUBB8Q3ZCM7 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TUBB8Q3ZCM7 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TUBB8Q3ZCM7 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TUBB8Q3ZCM7 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TUBB8Q3ZCM7 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TUBB8Q3ZCM7 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TUBB8Q3ZCM7 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TUBB8Q3ZCM7 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TUBB8Q3ZCM7 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TUBB8Q3ZCM7 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TUBB8Q3ZCM7 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TUBB8Q3ZCM7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TUBB8Q3ZCM7 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TUBB8Q3ZCM7 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TUBB8Q3ZCM7 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TUBB8Q3ZCM7 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TUBB8Q3ZCM7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TUBB8Q3ZCM7 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TUBB8Q3ZCM7 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TUBB8Q3ZCM7 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TUBB8Q3ZCM7 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TUBB8Q3ZCM7 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
TUBB8Q3ZCM7 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
TUBB8Q3ZCM7 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TUBB8Q3ZCM7 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TUBB8Q3ZCM7 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TUBB8Q3ZCM7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TUBB8Q3ZCM7 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TUBB8Q3ZCM7 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TUBB8Q3ZCM7 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TUBB8Q3ZCM7 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TUBB8Q3ZCM7 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TUBB8Q3ZCM7 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TUBB8Q3ZCM7 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TUBB8Q3ZCM7 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TUBB8Q3ZCM7 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TUBB8Q3ZCM7 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TUBB8Q3ZCM7 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TUBB8Q3ZCM7 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TUBB8Q3ZCM7 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TUBB8Q3ZCM7 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TUBB8Q3ZCM7 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TUBB8Q3ZCM7 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TUBB8Q3ZCM7 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TUBB8Q3ZCM7 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TUBB8Q3ZCM7 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TUBB8Q3ZCM7 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TUBB8Q3ZCM7 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TUBB8Q3ZCM7 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TUBB8Q3ZCM7 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TUBB8Q3ZCM7 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TUBB8Q3ZCM7 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TUBB8Q3ZCM7 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TUBB8Q3ZCM7 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TUBB8Q3ZCM7 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TUBB8Q3ZCM7 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms