Protein–RNA interactions for Protein: Q15544

TAF11, Transcription initiation factor TFIID subunit 11, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF11Q15544 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TAF11Q15544 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TAF11Q15544 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TAF11Q15544 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TAF11Q15544 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TAF11Q15544 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TAF11Q15544 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TAF11Q15544 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TAF11Q15544 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TAF11Q15544 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TAF11Q15544 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TAF11Q15544 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TAF11Q15544 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TAF11Q15544 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TAF11Q15544 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TAF11Q15544 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TAF11Q15544 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TAF11Q15544 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TAF11Q15544 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TAF11Q15544 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TAF11Q15544 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TAF11Q15544 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TAF11Q15544 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TAF11Q15544 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TAF11Q15544 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TAF11Q15544 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TAF11Q15544 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TAF11Q15544 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TAF11Q15544 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TAF11Q15544 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TAF11Q15544 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TAF11Q15544 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TAF11Q15544 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TAF11Q15544 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TAF11Q15544 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TAF11Q15544 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TAF11Q15544 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TAF11Q15544 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TAF11Q15544 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TAF11Q15544 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TAF11Q15544 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TAF11Q15544 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TAF11Q15544 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TAF11Q15544 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TAF11Q15544 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TAF11Q15544 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TAF11Q15544 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TAF11Q15544 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TAF11Q15544 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TAF11Q15544 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TAF11Q15544 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TAF11Q15544 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TAF11Q15544 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TAF11Q15544 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TAF11Q15544 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TAF11Q15544 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TAF11Q15544 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TAF11Q15544 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TAF11Q15544 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TAF11Q15544 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TAF11Q15544 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TAF11Q15544 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TAF11Q15544 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TAF11Q15544 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TAF11Q15544 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TAF11Q15544 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TAF11Q15544 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TAF11Q15544 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TAF11Q15544 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TAF11Q15544 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TAF11Q15544 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TAF11Q15544 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TAF11Q15544 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TAF11Q15544 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TAF11Q15544 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TAF11Q15544 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TAF11Q15544 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TAF11Q15544 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TAF11Q15544 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TAF11Q15544 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TAF11Q15544 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TAF11Q15544 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TAF11Q15544 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TAF11Q15544 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TAF11Q15544 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TAF11Q15544 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TAF11Q15544 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TAF11Q15544 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TAF11Q15544 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TAF11Q15544 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TAF11Q15544 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TAF11Q15544 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TAF11Q15544 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TAF11Q15544 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TAF11Q15544 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TAF11Q15544 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TAF11Q15544 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TAF11Q15544 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TAF11Q15544 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TAF11Q15544 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132.8 ms