Protein–RNA interactions for Protein: Q15366

PCBP2, Poly(rC)-binding protein 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP2Q15366 RNF13-211ENST00000470151 701 ntTSL 38.58□□□□□ -1.043e-8■■■■■ 52
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PCBP2Q15366 RNF13-204ENST00000459632 1008 ntTSL 45.74□□□□□ -1.493e-8■■■■■ 52
PCBP2Q15366 RNF13-206ENST00000466795 586 ntTSL 45.09□□□□□ -1.593e-8■■■■■ 52
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PCBP2Q15366 SNX24-202ENST00000395451 1050 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.332e-8■■■■■ 51.6
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PCBP2Q15366 PROCA1-208ENST00000579650 1007 ntTSL 1 (best)21.61■■□□□ 1.052e-10■■■■■ 51.6
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PCBP2Q15366 PROCA1-209ENST00000581289 766 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.882e-10■■■■■ 51.6
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PCBP2Q15366 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.224e-7■■■■■ 51.5
PCBP2Q15366 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.014e-7■■■■■ 51.5
PCBP2Q15366 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.114e-7■■■■■ 51.5
PCBP2Q15366 STAU1-208ENST00000437404 1085 ntTSL 1 (best)19.11■□□□□ 0.656e-8■■■■■ 51.5
PCBP2Q15366 STAU1-203ENST00000360426 3211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.576e-8■■■■■ 51.5
PCBP2Q15366 STAU1-205ENST00000371802 3154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.686e-8■■■■■ 51.5
PCBP2Q15366 STAU1-202ENST00000347458 3136 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.726e-8■■■■■ 51.5
PCBP2Q15366 STAU1-204ENST00000371792 3130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.726e-8■■■■■ 51.5
PCBP2Q15366 STAU1-201ENST00000340954 3334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.766e-8■■■■■ 51.5
PCBP2Q15366 STAU1-207ENST00000371856 3684 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.856e-8■■■■■ 51.5
PCBP2Q15366 STAU1-206ENST00000371828 3411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.896e-8■■■■■ 51.5
PCBP2Q15366 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.875e-7■■■■■ 51.5
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PCBP2Q15366 EIPR1-204ENST00000435721 672 ntTSL 317.97■□□□□ 0.475e-7■■■■■ 51.5
PCBP2Q15366 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.465e-7■■■■■ 51.5
PCBP2Q15366 EIPR1-205ENST00000441271 647 ntTSL 516.31■□□□□ 0.25e-7■■■■■ 51.5
PCBP2Q15366 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.185e-7■■■■■ 51.5
PCBP2Q15366 EIPR1-208ENST00000455162 847 ntTSL 510.24□□□□□ -0.775e-7■■■■■ 51.5
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PCBP2Q15366 GPS1-225ENST00000585084 997 ntTSL 326.4■■□□□ 1.822e-12■■■■■ 51.4
PCBP2Q15366 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.452e-12■■■■■ 51.4
PCBP2Q15366 GPS1-223ENST00000584229 535 ntTSL 323.82■■□□□ 1.42e-12■■■■■ 51.4
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