Protein–RNA interactions for Protein: Q14973

SLC10A1, Sodium/bile acid cotransporter, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A1Q14973 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC10A1Q14973 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC10A1Q14973 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC10A1Q14973 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC10A1Q14973 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC10A1Q14973 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC10A1Q14973 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC10A1Q14973 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC10A1Q14973 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC10A1Q14973 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC10A1Q14973 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC10A1Q14973 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC10A1Q14973 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC10A1Q14973 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC10A1Q14973 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC10A1Q14973 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC10A1Q14973 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC10A1Q14973 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC10A1Q14973 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC10A1Q14973 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC10A1Q14973 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC10A1Q14973 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC10A1Q14973 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC10A1Q14973 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC10A1Q14973 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC10A1Q14973 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC10A1Q14973 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC10A1Q14973 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC10A1Q14973 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC10A1Q14973 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC10A1Q14973 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC10A1Q14973 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC10A1Q14973 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC10A1Q14973 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC10A1Q14973 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC10A1Q14973 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC10A1Q14973 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC10A1Q14973 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC10A1Q14973 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC10A1Q14973 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC10A1Q14973 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC10A1Q14973 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC10A1Q14973 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC10A1Q14973 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC10A1Q14973 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC10A1Q14973 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC10A1Q14973 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC10A1Q14973 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC10A1Q14973 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC10A1Q14973 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC10A1Q14973 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC10A1Q14973 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC10A1Q14973 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC10A1Q14973 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC10A1Q14973 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC10A1Q14973 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC10A1Q14973 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC10A1Q14973 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC10A1Q14973 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC10A1Q14973 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC10A1Q14973 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC10A1Q14973 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC10A1Q14973 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC10A1Q14973 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC10A1Q14973 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC10A1Q14973 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC10A1Q14973 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC10A1Q14973 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC10A1Q14973 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC10A1Q14973 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC10A1Q14973 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC10A1Q14973 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC10A1Q14973 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC10A1Q14973 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC10A1Q14973 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC10A1Q14973 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC10A1Q14973 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC10A1Q14973 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC10A1Q14973 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC10A1Q14973 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC10A1Q14973 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC10A1Q14973 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC10A1Q14973 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC10A1Q14973 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC10A1Q14973 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC10A1Q14973 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC10A1Q14973 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC10A1Q14973 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC10A1Q14973 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC10A1Q14973 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC10A1Q14973 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC10A1Q14973 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC10A1Q14973 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC10A1Q14973 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC10A1Q14973 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC10A1Q14973 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC10A1Q14973 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC10A1Q14973 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC10A1Q14973 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC10A1Q14973 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
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