Protein–RNA interactions for Protein: Q14511

NEDD9, Enhancer of filamentation 1, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD9Q14511 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NEDD9Q14511 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NEDD9Q14511 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NEDD9Q14511 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
NEDD9Q14511 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NEDD9Q14511 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NEDD9Q14511 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NEDD9Q14511 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NEDD9Q14511 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NEDD9Q14511 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NEDD9Q14511 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NEDD9Q14511 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NEDD9Q14511 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NEDD9Q14511 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NEDD9Q14511 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NEDD9Q14511 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NEDD9Q14511 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NEDD9Q14511 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NEDD9Q14511 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NEDD9Q14511 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NEDD9Q14511 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NEDD9Q14511 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NEDD9Q14511 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NEDD9Q14511 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NEDD9Q14511 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NEDD9Q14511 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NEDD9Q14511 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NEDD9Q14511 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NEDD9Q14511 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NEDD9Q14511 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
NEDD9Q14511 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NEDD9Q14511 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NEDD9Q14511 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NEDD9Q14511 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NEDD9Q14511 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NEDD9Q14511 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NEDD9Q14511 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NEDD9Q14511 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NEDD9Q14511 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NEDD9Q14511 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NEDD9Q14511 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
NEDD9Q14511 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NEDD9Q14511 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NEDD9Q14511 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NEDD9Q14511 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NEDD9Q14511 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NEDD9Q14511 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NEDD9Q14511 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NEDD9Q14511 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NEDD9Q14511 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NEDD9Q14511 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NEDD9Q14511 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NEDD9Q14511 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
NEDD9Q14511 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NEDD9Q14511 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NEDD9Q14511 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NEDD9Q14511 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NEDD9Q14511 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NEDD9Q14511 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NEDD9Q14511 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NEDD9Q14511 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NEDD9Q14511 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NEDD9Q14511 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NEDD9Q14511 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NEDD9Q14511 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NEDD9Q14511 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NEDD9Q14511 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NEDD9Q14511 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NEDD9Q14511 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NEDD9Q14511 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NEDD9Q14511 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NEDD9Q14511 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NEDD9Q14511 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NEDD9Q14511 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NEDD9Q14511 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NEDD9Q14511 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NEDD9Q14511 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NEDD9Q14511 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NEDD9Q14511 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NEDD9Q14511 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
NEDD9Q14511 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NEDD9Q14511 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NEDD9Q14511 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NEDD9Q14511 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NEDD9Q14511 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NEDD9Q14511 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
NEDD9Q14511 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NEDD9Q14511 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
NEDD9Q14511 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NEDD9Q14511 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NEDD9Q14511 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NEDD9Q14511 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NEDD9Q14511 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NEDD9Q14511 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NEDD9Q14511 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NEDD9Q14511 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NEDD9Q14511 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NEDD9Q14511 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
NEDD9Q14511 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NEDD9Q14511 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
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