Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCARB2Q14108 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCARB2Q14108 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCARB2Q14108 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCARB2Q14108 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCARB2Q14108 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCARB2Q14108 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCARB2Q14108 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
SCARB2Q14108 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SCARB2Q14108 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SCARB2Q14108 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SCARB2Q14108 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SCARB2Q14108 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCARB2Q14108 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SCARB2Q14108 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCARB2Q14108 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCARB2Q14108 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCARB2Q14108 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCARB2Q14108 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCARB2Q14108 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCARB2Q14108 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCARB2Q14108 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCARB2Q14108 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCARB2Q14108 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCARB2Q14108 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCARB2Q14108 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCARB2Q14108 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCARB2Q14108 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCARB2Q14108 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCARB2Q14108 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCARB2Q14108 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCARB2Q14108 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCARB2Q14108 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCARB2Q14108 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCARB2Q14108 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCARB2Q14108 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SCARB2Q14108 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCARB2Q14108 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCARB2Q14108 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCARB2Q14108 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCARB2Q14108 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCARB2Q14108 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCARB2Q14108 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCARB2Q14108 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCARB2Q14108 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCARB2Q14108 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCARB2Q14108 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCARB2Q14108 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCARB2Q14108 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCARB2Q14108 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCARB2Q14108 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCARB2Q14108 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCARB2Q14108 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCARB2Q14108 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCARB2Q14108 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCARB2Q14108 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCARB2Q14108 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCARB2Q14108 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCARB2Q14108 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCARB2Q14108 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCARB2Q14108 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCARB2Q14108 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCARB2Q14108 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCARB2Q14108 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCARB2Q14108 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCARB2Q14108 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCARB2Q14108 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SCARB2Q14108 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCARB2Q14108 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCARB2Q14108 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SCARB2Q14108 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SCARB2Q14108 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCARB2Q14108 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCARB2Q14108 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCARB2Q14108 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCARB2Q14108 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCARB2Q14108 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCARB2Q14108 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCARB2Q14108 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCARB2Q14108 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCARB2Q14108 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCARB2Q14108 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCARB2Q14108 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SCARB2Q14108 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCARB2Q14108 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCARB2Q14108 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCARB2Q14108 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCARB2Q14108 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCARB2Q14108 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCARB2Q14108 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCARB2Q14108 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SCARB2Q14108 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCARB2Q14108 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCARB2Q14108 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCARB2Q14108 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCARB2Q14108 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCARB2Q14108 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCARB2Q14108 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCARB2Q14108 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCARB2Q14108 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
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