Protein–RNA interactions for Protein: Q09470

KCNA1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA1Q09470 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KCNA1Q09470 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KCNA1Q09470 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
KCNA1Q09470 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KCNA1Q09470 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KCNA1Q09470 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KCNA1Q09470 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KCNA1Q09470 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KCNA1Q09470 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
KCNA1Q09470 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KCNA1Q09470 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KCNA1Q09470 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
KCNA1Q09470 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
KCNA1Q09470 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KCNA1Q09470 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
KCNA1Q09470 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KCNA1Q09470 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KCNA1Q09470 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
KCNA1Q09470 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
KCNA1Q09470 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
KCNA1Q09470 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KCNA1Q09470 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KCNA1Q09470 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KCNA1Q09470 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
KCNA1Q09470 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KCNA1Q09470 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KCNA1Q09470 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KCNA1Q09470 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KCNA1Q09470 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KCNA1Q09470 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KCNA1Q09470 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KCNA1Q09470 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KCNA1Q09470 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KCNA1Q09470 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KCNA1Q09470 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KCNA1Q09470 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KCNA1Q09470 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KCNA1Q09470 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KCNA1Q09470 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KCNA1Q09470 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KCNA1Q09470 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KCNA1Q09470 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KCNA1Q09470 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KCNA1Q09470 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KCNA1Q09470 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KCNA1Q09470 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KCNA1Q09470 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KCNA1Q09470 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KCNA1Q09470 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KCNA1Q09470 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KCNA1Q09470 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KCNA1Q09470 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KCNA1Q09470 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KCNA1Q09470 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KCNA1Q09470 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KCNA1Q09470 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KCNA1Q09470 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KCNA1Q09470 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KCNA1Q09470 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KCNA1Q09470 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KCNA1Q09470 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KCNA1Q09470 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KCNA1Q09470 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KCNA1Q09470 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KCNA1Q09470 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
KCNA1Q09470 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
KCNA1Q09470 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KCNA1Q09470 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KCNA1Q09470 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KCNA1Q09470 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KCNA1Q09470 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KCNA1Q09470 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KCNA1Q09470 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KCNA1Q09470 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KCNA1Q09470 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KCNA1Q09470 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KCNA1Q09470 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KCNA1Q09470 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KCNA1Q09470 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KCNA1Q09470 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KCNA1Q09470 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KCNA1Q09470 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KCNA1Q09470 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KCNA1Q09470 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KCNA1Q09470 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KCNA1Q09470 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KCNA1Q09470 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KCNA1Q09470 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KCNA1Q09470 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KCNA1Q09470 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KCNA1Q09470 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KCNA1Q09470 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KCNA1Q09470 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KCNA1Q09470 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KCNA1Q09470 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KCNA1Q09470 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KCNA1Q09470 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KCNA1Q09470 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KCNA1Q09470 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KCNA1Q09470 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms