Protein–RNA interactions for Protein: Q06945

SOX4, Transcription factor SOX-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX4Q06945 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SOX4Q06945 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SOX4Q06945 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SOX4Q06945 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SOX4Q06945 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SOX4Q06945 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SOX4Q06945 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SOX4Q06945 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SOX4Q06945 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SOX4Q06945 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SOX4Q06945 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SOX4Q06945 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SOX4Q06945 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SOX4Q06945 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SOX4Q06945 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SOX4Q06945 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SOX4Q06945 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SOX4Q06945 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SOX4Q06945 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SOX4Q06945 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SOX4Q06945 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SOX4Q06945 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SOX4Q06945 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SOX4Q06945 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SOX4Q06945 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SOX4Q06945 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SOX4Q06945 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SOX4Q06945 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SOX4Q06945 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SOX4Q06945 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SOX4Q06945 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SOX4Q06945 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SOX4Q06945 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
SOX4Q06945 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
SOX4Q06945 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SOX4Q06945 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SOX4Q06945 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SOX4Q06945 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SOX4Q06945 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SOX4Q06945 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SOX4Q06945 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SOX4Q06945 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SOX4Q06945 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
SOX4Q06945 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SOX4Q06945 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
SOX4Q06945 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SOX4Q06945 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SOX4Q06945 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SOX4Q06945 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SOX4Q06945 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SOX4Q06945 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SOX4Q06945 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SOX4Q06945 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SOX4Q06945 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
SOX4Q06945 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SOX4Q06945 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SOX4Q06945 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SOX4Q06945 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SOX4Q06945 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SOX4Q06945 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SOX4Q06945 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SOX4Q06945 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SOX4Q06945 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SOX4Q06945 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SOX4Q06945 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SOX4Q06945 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SOX4Q06945 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SOX4Q06945 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SOX4Q06945 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SOX4Q06945 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SOX4Q06945 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SOX4Q06945 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SOX4Q06945 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SOX4Q06945 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SOX4Q06945 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SOX4Q06945 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SOX4Q06945 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SOX4Q06945 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SOX4Q06945 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SOX4Q06945 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SOX4Q06945 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SOX4Q06945 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SOX4Q06945 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SOX4Q06945 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SOX4Q06945 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SOX4Q06945 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SOX4Q06945 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SOX4Q06945 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SOX4Q06945 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SOX4Q06945 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
SOX4Q06945 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SOX4Q06945 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SOX4Q06945 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SOX4Q06945 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SOX4Q06945 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SOX4Q06945 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SOX4Q06945 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SOX4Q06945 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SOX4Q06945 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SOX4Q06945 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms