Protein–RNA interactions for Protein: Q06265

EXOSC9, Exosome complex component RRP45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC9Q06265 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
EXOSC9Q06265 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
EXOSC9Q06265 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
EXOSC9Q06265 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
EXOSC9Q06265 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
EXOSC9Q06265 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
EXOSC9Q06265 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
EXOSC9Q06265 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
EXOSC9Q06265 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
EXOSC9Q06265 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
EXOSC9Q06265 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
EXOSC9Q06265 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC30.74■■■□□ 2.51
EXOSC9Q06265 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC30.74■■■□□ 2.51
EXOSC9Q06265 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
EXOSC9Q06265 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
EXOSC9Q06265 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
EXOSC9Q06265 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC30.74■■■□□ 2.51
EXOSC9Q06265 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
EXOSC9Q06265 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
EXOSC9Q06265 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
EXOSC9Q06265 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
EXOSC9Q06265 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
EXOSC9Q06265 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
EXOSC9Q06265 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
EXOSC9Q06265 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
EXOSC9Q06265 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
EXOSC9Q06265 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
EXOSC9Q06265 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
EXOSC9Q06265 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
EXOSC9Q06265 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC30.72■■■□□ 2.51
EXOSC9Q06265 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
EXOSC9Q06265 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
EXOSC9Q06265 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
EXOSC9Q06265 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
EXOSC9Q06265 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
EXOSC9Q06265 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
EXOSC9Q06265 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
EXOSC9Q06265 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
EXOSC9Q06265 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
EXOSC9Q06265 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
EXOSC9Q06265 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
EXOSC9Q06265 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
EXOSC9Q06265 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
EXOSC9Q06265 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
EXOSC9Q06265 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
EXOSC9Q06265 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
EXOSC9Q06265 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
EXOSC9Q06265 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
EXOSC9Q06265 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC30.7■■■□□ 2.51
EXOSC9Q06265 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
EXOSC9Q06265 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
EXOSC9Q06265 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
EXOSC9Q06265 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
EXOSC9Q06265 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
EXOSC9Q06265 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
EXOSC9Q06265 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC30.68■■■□□ 2.5
EXOSC9Q06265 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
EXOSC9Q06265 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
EXOSC9Q06265 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
EXOSC9Q06265 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
EXOSC9Q06265 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
EXOSC9Q06265 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
EXOSC9Q06265 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC30.67■■■□□ 2.5
EXOSC9Q06265 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
EXOSC9Q06265 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
EXOSC9Q06265 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
EXOSC9Q06265 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
EXOSC9Q06265 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
EXOSC9Q06265 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
EXOSC9Q06265 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
EXOSC9Q06265 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
EXOSC9Q06265 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
EXOSC9Q06265 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
EXOSC9Q06265 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
EXOSC9Q06265 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC30.64■■■□□ 2.5
EXOSC9Q06265 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
EXOSC9Q06265 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
EXOSC9Q06265 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
EXOSC9Q06265 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.49
EXOSC9Q06265 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
EXOSC9Q06265 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
EXOSC9Q06265 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
EXOSC9Q06265 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
EXOSC9Q06265 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
EXOSC9Q06265 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
EXOSC9Q06265 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
EXOSC9Q06265 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
EXOSC9Q06265 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
EXOSC9Q06265 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
EXOSC9Q06265 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
EXOSC9Q06265 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
EXOSC9Q06265 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
EXOSC9Q06265 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
EXOSC9Q06265 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
EXOSC9Q06265 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
EXOSC9Q06265 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
EXOSC9Q06265 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
EXOSC9Q06265 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
EXOSC9Q06265 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
EXOSC9Q06265 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms