Protein–RNA interactions for Protein: P53673

CRYBA4, Beta-crystallin A4, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRYBA4P53673 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CRYBA4P53673 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CRYBA4P53673 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CRYBA4P53673 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CRYBA4P53673 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CRYBA4P53673 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CRYBA4P53673 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CRYBA4P53673 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CRYBA4P53673 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CRYBA4P53673 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CRYBA4P53673 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CRYBA4P53673 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CRYBA4P53673 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CRYBA4P53673 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CRYBA4P53673 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CRYBA4P53673 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CRYBA4P53673 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CRYBA4P53673 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CRYBA4P53673 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CRYBA4P53673 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CRYBA4P53673 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CRYBA4P53673 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CRYBA4P53673 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CRYBA4P53673 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CRYBA4P53673 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CRYBA4P53673 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CRYBA4P53673 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CRYBA4P53673 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CRYBA4P53673 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CRYBA4P53673 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CRYBA4P53673 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CRYBA4P53673 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CRYBA4P53673 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CRYBA4P53673 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CRYBA4P53673 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CRYBA4P53673 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CRYBA4P53673 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CRYBA4P53673 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CRYBA4P53673 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CRYBA4P53673 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CRYBA4P53673 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CRYBA4P53673 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CRYBA4P53673 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CRYBA4P53673 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CRYBA4P53673 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CRYBA4P53673 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CRYBA4P53673 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CRYBA4P53673 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CRYBA4P53673 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CRYBA4P53673 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CRYBA4P53673 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
CRYBA4P53673 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CRYBA4P53673 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CRYBA4P53673 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CRYBA4P53673 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CRYBA4P53673 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CRYBA4P53673 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CRYBA4P53673 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CRYBA4P53673 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CRYBA4P53673 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CRYBA4P53673 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CRYBA4P53673 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CRYBA4P53673 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CRYBA4P53673 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CRYBA4P53673 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CRYBA4P53673 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CRYBA4P53673 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CRYBA4P53673 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CRYBA4P53673 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CRYBA4P53673 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CRYBA4P53673 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CRYBA4P53673 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CRYBA4P53673 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CRYBA4P53673 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CRYBA4P53673 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CRYBA4P53673 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CRYBA4P53673 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CRYBA4P53673 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CRYBA4P53673 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CRYBA4P53673 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CRYBA4P53673 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CRYBA4P53673 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CRYBA4P53673 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CRYBA4P53673 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CRYBA4P53673 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CRYBA4P53673 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CRYBA4P53673 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CRYBA4P53673 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CRYBA4P53673 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CRYBA4P53673 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CRYBA4P53673 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CRYBA4P53673 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CRYBA4P53673 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CRYBA4P53673 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CRYBA4P53673 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CRYBA4P53673 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CRYBA4P53673 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CRYBA4P53673 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CRYBA4P53673 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CRYBA4P53673 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.6 ms