Protein–RNA interactions for Protein: P48304

REG1B, Lithostathine-1-beta, humanhuman

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REG1BP48304 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
REG1BP48304 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
REG1BP48304 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
REG1BP48304 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
REG1BP48304 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
REG1BP48304 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
REG1BP48304 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
REG1BP48304 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
REG1BP48304 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
REG1BP48304 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
REG1BP48304 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
REG1BP48304 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
REG1BP48304 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
REG1BP48304 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
REG1BP48304 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
REG1BP48304 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
REG1BP48304 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
REG1BP48304 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
REG1BP48304 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
REG1BP48304 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
REG1BP48304 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
REG1BP48304 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
REG1BP48304 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
REG1BP48304 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
REG1BP48304 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
REG1BP48304 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
REG1BP48304 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
REG1BP48304 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
REG1BP48304 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
REG1BP48304 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
REG1BP48304 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
REG1BP48304 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
REG1BP48304 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
REG1BP48304 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
REG1BP48304 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
REG1BP48304 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
REG1BP48304 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
REG1BP48304 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
REG1BP48304 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
REG1BP48304 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
REG1BP48304 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
REG1BP48304 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
REG1BP48304 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
REG1BP48304 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
REG1BP48304 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
REG1BP48304 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
REG1BP48304 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
REG1BP48304 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
REG1BP48304 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
REG1BP48304 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
REG1BP48304 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
REG1BP48304 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
REG1BP48304 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
REG1BP48304 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
REG1BP48304 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
REG1BP48304 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
REG1BP48304 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
REG1BP48304 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
REG1BP48304 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
REG1BP48304 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
REG1BP48304 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
REG1BP48304 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
REG1BP48304 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
REG1BP48304 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
REG1BP48304 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
REG1BP48304 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
REG1BP48304 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
REG1BP48304 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
REG1BP48304 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
REG1BP48304 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
REG1BP48304 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
REG1BP48304 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
REG1BP48304 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
REG1BP48304 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
REG1BP48304 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
REG1BP48304 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
REG1BP48304 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
REG1BP48304 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
REG1BP48304 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
REG1BP48304 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
REG1BP48304 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
REG1BP48304 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
REG1BP48304 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
REG1BP48304 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
REG1BP48304 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
REG1BP48304 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
REG1BP48304 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
REG1BP48304 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
REG1BP48304 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
REG1BP48304 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
REG1BP48304 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
REG1BP48304 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
REG1BP48304 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
REG1BP48304 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
REG1BP48304 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
REG1BP48304 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
REG1BP48304 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
REG1BP48304 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
REG1BP48304 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
REG1BP48304 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms