Protein–RNA interactions for Protein: P24522

GADD45A, Growth arrest and DNA damage-inducible protein GADD45 alpha, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45AP24522 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
GADD45AP24522 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GADD45AP24522 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GADD45AP24522 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GADD45AP24522 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GADD45AP24522 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GADD45AP24522 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GADD45AP24522 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GADD45AP24522 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GADD45AP24522 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GADD45AP24522 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GADD45AP24522 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.2■□□□□ 0.99
GADD45AP24522 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GADD45AP24522 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GADD45AP24522 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GADD45AP24522 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GADD45AP24522 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GADD45AP24522 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GADD45AP24522 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GADD45AP24522 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GADD45AP24522 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GADD45AP24522 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GADD45AP24522 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GADD45AP24522 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
GADD45AP24522 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GADD45AP24522 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GADD45AP24522 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GADD45AP24522 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GADD45AP24522 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GADD45AP24522 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GADD45AP24522 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GADD45AP24522 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GADD45AP24522 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GADD45AP24522 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GADD45AP24522 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GADD45AP24522 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GADD45AP24522 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GADD45AP24522 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GADD45AP24522 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GADD45AP24522 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GADD45AP24522 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GADD45AP24522 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GADD45AP24522 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GADD45AP24522 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GADD45AP24522 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GADD45AP24522 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GADD45AP24522 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GADD45AP24522 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GADD45AP24522 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GADD45AP24522 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GADD45AP24522 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GADD45AP24522 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GADD45AP24522 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GADD45AP24522 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GADD45AP24522 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GADD45AP24522 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
GADD45AP24522 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GADD45AP24522 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GADD45AP24522 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GADD45AP24522 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GADD45AP24522 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GADD45AP24522 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GADD45AP24522 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GADD45AP24522 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GADD45AP24522 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GADD45AP24522 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GADD45AP24522 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GADD45AP24522 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GADD45AP24522 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GADD45AP24522 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GADD45AP24522 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GADD45AP24522 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GADD45AP24522 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GADD45AP24522 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GADD45AP24522 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
GADD45AP24522 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GADD45AP24522 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GADD45AP24522 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GADD45AP24522 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GADD45AP24522 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GADD45AP24522 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
GADD45AP24522 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GADD45AP24522 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GADD45AP24522 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
GADD45AP24522 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GADD45AP24522 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GADD45AP24522 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GADD45AP24522 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GADD45AP24522 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GADD45AP24522 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GADD45AP24522 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GADD45AP24522 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GADD45AP24522 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GADD45AP24522 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GADD45AP24522 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GADD45AP24522 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GADD45AP24522 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GADD45AP24522 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GADD45AP24522 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GADD45AP24522 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.7 ms