Protein–RNA interactions for Protein: P23297

S100A1, Protein S100-A1, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
S100A1P23297 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
S100A1P23297 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
S100A1P23297 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
S100A1P23297 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
S100A1P23297 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
S100A1P23297 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
S100A1P23297 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
S100A1P23297 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
S100A1P23297 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
S100A1P23297 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
S100A1P23297 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
S100A1P23297 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
S100A1P23297 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
S100A1P23297 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
S100A1P23297 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
S100A1P23297 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
S100A1P23297 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
S100A1P23297 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
S100A1P23297 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
S100A1P23297 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
S100A1P23297 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
S100A1P23297 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
S100A1P23297 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
S100A1P23297 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
S100A1P23297 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
S100A1P23297 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
S100A1P23297 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
S100A1P23297 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
S100A1P23297 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
S100A1P23297 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
S100A1P23297 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
S100A1P23297 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
S100A1P23297 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
S100A1P23297 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
S100A1P23297 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
S100A1P23297 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
S100A1P23297 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
S100A1P23297 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
S100A1P23297 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
S100A1P23297 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
S100A1P23297 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
S100A1P23297 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
S100A1P23297 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
S100A1P23297 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
S100A1P23297 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
S100A1P23297 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
S100A1P23297 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
S100A1P23297 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
S100A1P23297 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
S100A1P23297 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
S100A1P23297 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
S100A1P23297 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
S100A1P23297 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
S100A1P23297 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
S100A1P23297 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
S100A1P23297 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
S100A1P23297 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
S100A1P23297 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
S100A1P23297 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
S100A1P23297 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
S100A1P23297 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
S100A1P23297 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
S100A1P23297 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
S100A1P23297 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
S100A1P23297 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
S100A1P23297 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
S100A1P23297 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
S100A1P23297 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
S100A1P23297 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
S100A1P23297 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
S100A1P23297 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
S100A1P23297 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
S100A1P23297 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
S100A1P23297 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
S100A1P23297 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
S100A1P23297 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
S100A1P23297 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
S100A1P23297 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
S100A1P23297 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
S100A1P23297 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
S100A1P23297 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
S100A1P23297 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
S100A1P23297 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
S100A1P23297 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
S100A1P23297 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
S100A1P23297 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
S100A1P23297 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
S100A1P23297 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
S100A1P23297 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
S100A1P23297 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
S100A1P23297 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
S100A1P23297 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
S100A1P23297 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
S100A1P23297 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
S100A1P23297 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
S100A1P23297 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
S100A1P23297 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
S100A1P23297 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
S100A1P23297 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
S100A1P23297 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.8 ms