Protein–RNA interactions for Protein: P19793

RXRA, Retinoic acid receptor RXR-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RXRAP19793 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RXRAP19793 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RXRAP19793 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RXRAP19793 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RXRAP19793 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RXRAP19793 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RXRAP19793 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RXRAP19793 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RXRAP19793 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RXRAP19793 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RXRAP19793 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RXRAP19793 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RXRAP19793 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RXRAP19793 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RXRAP19793 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RXRAP19793 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RXRAP19793 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
RXRAP19793 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RXRAP19793 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RXRAP19793 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RXRAP19793 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RXRAP19793 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RXRAP19793 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RXRAP19793 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RXRAP19793 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RXRAP19793 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RXRAP19793 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RXRAP19793 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RXRAP19793 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RXRAP19793 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RXRAP19793 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RXRAP19793 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RXRAP19793 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RXRAP19793 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
RXRAP19793 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RXRAP19793 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RXRAP19793 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RXRAP19793 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RXRAP19793 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RXRAP19793 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RXRAP19793 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RXRAP19793 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RXRAP19793 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RXRAP19793 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RXRAP19793 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RXRAP19793 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RXRAP19793 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
RXRAP19793 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RXRAP19793 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RXRAP19793 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RXRAP19793 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RXRAP19793 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RXRAP19793 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RXRAP19793 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RXRAP19793 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RXRAP19793 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RXRAP19793 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RXRAP19793 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RXRAP19793 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RXRAP19793 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RXRAP19793 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RXRAP19793 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RXRAP19793 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RXRAP19793 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
RXRAP19793 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RXRAP19793 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RXRAP19793 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RXRAP19793 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
RXRAP19793 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RXRAP19793 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RXRAP19793 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RXRAP19793 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RXRAP19793 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RXRAP19793 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RXRAP19793 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RXRAP19793 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RXRAP19793 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RXRAP19793 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RXRAP19793 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RXRAP19793 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
RXRAP19793 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RXRAP19793 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RXRAP19793 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
RXRAP19793 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
RXRAP19793 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RXRAP19793 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RXRAP19793 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RXRAP19793 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
RXRAP19793 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RXRAP19793 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RXRAP19793 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RXRAP19793 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RXRAP19793 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
RXRAP19793 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RXRAP19793 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RXRAP19793 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RXRAP19793 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RXRAP19793 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RXRAP19793 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RXRAP19793 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 716.3 ms