Protein–RNA interactions for Protein: P0C881

RSPH10B, Radial spoke head 10 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPH10BP0C881 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RSPH10BP0C881 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RSPH10BP0C881 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RSPH10BP0C881 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RSPH10BP0C881 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RSPH10BP0C881 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RSPH10BP0C881 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RSPH10BP0C881 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RSPH10BP0C881 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RSPH10BP0C881 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RSPH10BP0C881 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
RSPH10BP0C881 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
RSPH10BP0C881 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RSPH10BP0C881 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RSPH10BP0C881 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RSPH10BP0C881 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RSPH10BP0C881 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RSPH10BP0C881 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
RSPH10BP0C881 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RSPH10BP0C881 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
RSPH10BP0C881 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RSPH10BP0C881 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RSPH10BP0C881 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RSPH10BP0C881 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RSPH10BP0C881 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
RSPH10BP0C881 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RSPH10BP0C881 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RSPH10BP0C881 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RSPH10BP0C881 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RSPH10BP0C881 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RSPH10BP0C881 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RSPH10BP0C881 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
RSPH10BP0C881 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RSPH10BP0C881 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
RSPH10BP0C881 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RSPH10BP0C881 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RSPH10BP0C881 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RSPH10BP0C881 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RSPH10BP0C881 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RSPH10BP0C881 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RSPH10BP0C881 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RSPH10BP0C881 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RSPH10BP0C881 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RSPH10BP0C881 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RSPH10BP0C881 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RSPH10BP0C881 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RSPH10BP0C881 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RSPH10BP0C881 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RSPH10BP0C881 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RSPH10BP0C881 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RSPH10BP0C881 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RSPH10BP0C881 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RSPH10BP0C881 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RSPH10BP0C881 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RSPH10BP0C881 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RSPH10BP0C881 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RSPH10BP0C881 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RSPH10BP0C881 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RSPH10BP0C881 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RSPH10BP0C881 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RSPH10BP0C881 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RSPH10BP0C881 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RSPH10BP0C881 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
RSPH10BP0C881 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RSPH10BP0C881 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RSPH10BP0C881 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RSPH10BP0C881 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
RSPH10BP0C881 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RSPH10BP0C881 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RSPH10BP0C881 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RSPH10BP0C881 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RSPH10BP0C881 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RSPH10BP0C881 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RSPH10BP0C881 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RSPH10BP0C881 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RSPH10BP0C881 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RSPH10BP0C881 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RSPH10BP0C881 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RSPH10BP0C881 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RSPH10BP0C881 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RSPH10BP0C881 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RSPH10BP0C881 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RSPH10BP0C881 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RSPH10BP0C881 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RSPH10BP0C881 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RSPH10BP0C881 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RSPH10BP0C881 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RSPH10BP0C881 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RSPH10BP0C881 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RSPH10BP0C881 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RSPH10BP0C881 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RSPH10BP0C881 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RSPH10BP0C881 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RSPH10BP0C881 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RSPH10BP0C881 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RSPH10BP0C881 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
RSPH10BP0C881 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RSPH10BP0C881 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RSPH10BP0C881 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RSPH10BP0C881 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 275.8 ms