Protein–RNA interactions for Protein: O95985

TOP3B, DNA topoisomerase 3-beta-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3BO95985 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TOP3BO95985 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TOP3BO95985 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TOP3BO95985 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TOP3BO95985 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TOP3BO95985 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TOP3BO95985 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TOP3BO95985 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TOP3BO95985 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TOP3BO95985 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TOP3BO95985 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TOP3BO95985 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TOP3BO95985 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TOP3BO95985 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TOP3BO95985 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TOP3BO95985 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TOP3BO95985 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TOP3BO95985 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TOP3BO95985 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TOP3BO95985 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TOP3BO95985 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TOP3BO95985 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TOP3BO95985 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TOP3BO95985 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TOP3BO95985 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TOP3BO95985 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TOP3BO95985 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TOP3BO95985 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TOP3BO95985 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TOP3BO95985 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TOP3BO95985 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TOP3BO95985 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TOP3BO95985 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TOP3BO95985 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TOP3BO95985 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TOP3BO95985 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TOP3BO95985 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TOP3BO95985 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TOP3BO95985 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TOP3BO95985 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TOP3BO95985 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TOP3BO95985 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TOP3BO95985 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TOP3BO95985 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TOP3BO95985 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TOP3BO95985 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TOP3BO95985 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TOP3BO95985 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TOP3BO95985 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TOP3BO95985 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TOP3BO95985 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TOP3BO95985 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TOP3BO95985 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TOP3BO95985 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TOP3BO95985 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TOP3BO95985 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TOP3BO95985 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TOP3BO95985 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TOP3BO95985 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TOP3BO95985 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TOP3BO95985 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TOP3BO95985 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TOP3BO95985 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TOP3BO95985 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TOP3BO95985 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TOP3BO95985 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TOP3BO95985 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TOP3BO95985 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TOP3BO95985 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TOP3BO95985 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TOP3BO95985 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TOP3BO95985 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TOP3BO95985 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TOP3BO95985 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TOP3BO95985 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TOP3BO95985 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TOP3BO95985 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TOP3BO95985 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TOP3BO95985 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TOP3BO95985 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TOP3BO95985 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TOP3BO95985 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TOP3BO95985 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TOP3BO95985 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TOP3BO95985 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TOP3BO95985 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TOP3BO95985 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TOP3BO95985 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TOP3BO95985 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TOP3BO95985 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TOP3BO95985 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TOP3BO95985 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TOP3BO95985 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TOP3BO95985 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TOP3BO95985 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TOP3BO95985 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TOP3BO95985 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TOP3BO95985 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TOP3BO95985 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TOP3BO95985 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms