Protein–RNA interactions for Protein: O95900

TRUB2, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase TRUB2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRUB2O95900 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRUB2O95900 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRUB2O95900 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRUB2O95900 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TRUB2O95900 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRUB2O95900 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRUB2O95900 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRUB2O95900 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRUB2O95900 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TRUB2O95900 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRUB2O95900 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRUB2O95900 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRUB2O95900 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRUB2O95900 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRUB2O95900 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRUB2O95900 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRUB2O95900 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRUB2O95900 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRUB2O95900 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRUB2O95900 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRUB2O95900 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRUB2O95900 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRUB2O95900 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRUB2O95900 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRUB2O95900 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRUB2O95900 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRUB2O95900 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRUB2O95900 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRUB2O95900 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRUB2O95900 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRUB2O95900 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRUB2O95900 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRUB2O95900 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TRUB2O95900 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRUB2O95900 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRUB2O95900 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRUB2O95900 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRUB2O95900 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRUB2O95900 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRUB2O95900 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRUB2O95900 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRUB2O95900 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRUB2O95900 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRUB2O95900 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TRUB2O95900 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TRUB2O95900 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRUB2O95900 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRUB2O95900 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRUB2O95900 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRUB2O95900 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRUB2O95900 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRUB2O95900 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TRUB2O95900 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRUB2O95900 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRUB2O95900 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRUB2O95900 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRUB2O95900 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRUB2O95900 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRUB2O95900 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRUB2O95900 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRUB2O95900 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRUB2O95900 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRUB2O95900 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRUB2O95900 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRUB2O95900 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRUB2O95900 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
TRUB2O95900 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
TRUB2O95900 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRUB2O95900 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRUB2O95900 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRUB2O95900 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRUB2O95900 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRUB2O95900 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRUB2O95900 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRUB2O95900 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRUB2O95900 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRUB2O95900 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRUB2O95900 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRUB2O95900 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRUB2O95900 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRUB2O95900 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRUB2O95900 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRUB2O95900 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRUB2O95900 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRUB2O95900 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRUB2O95900 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRUB2O95900 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRUB2O95900 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TRUB2O95900 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRUB2O95900 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRUB2O95900 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
TRUB2O95900 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TRUB2O95900 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRUB2O95900 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRUB2O95900 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
TRUB2O95900 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRUB2O95900 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRUB2O95900 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRUB2O95900 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRUB2O95900 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.3 ms