Protein–RNA interactions for Protein: O95447

LCA5L, Lebercilin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCA5LO95447 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LCA5LO95447 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LCA5LO95447 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LCA5LO95447 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LCA5LO95447 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LCA5LO95447 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LCA5LO95447 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LCA5LO95447 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LCA5LO95447 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LCA5LO95447 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LCA5LO95447 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LCA5LO95447 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LCA5LO95447 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LCA5LO95447 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LCA5LO95447 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LCA5LO95447 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LCA5LO95447 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LCA5LO95447 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LCA5LO95447 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
LCA5LO95447 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LCA5LO95447 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LCA5LO95447 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LCA5LO95447 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LCA5LO95447 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LCA5LO95447 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LCA5LO95447 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LCA5LO95447 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LCA5LO95447 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LCA5LO95447 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LCA5LO95447 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LCA5LO95447 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LCA5LO95447 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LCA5LO95447 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LCA5LO95447 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LCA5LO95447 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LCA5LO95447 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LCA5LO95447 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LCA5LO95447 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LCA5LO95447 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LCA5LO95447 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LCA5LO95447 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LCA5LO95447 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LCA5LO95447 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
LCA5LO95447 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LCA5LO95447 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LCA5LO95447 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LCA5LO95447 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LCA5LO95447 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LCA5LO95447 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LCA5LO95447 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LCA5LO95447 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LCA5LO95447 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LCA5LO95447 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LCA5LO95447 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
LCA5LO95447 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LCA5LO95447 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LCA5LO95447 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LCA5LO95447 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LCA5LO95447 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LCA5LO95447 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LCA5LO95447 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LCA5LO95447 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LCA5LO95447 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LCA5LO95447 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LCA5LO95447 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
LCA5LO95447 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
LCA5LO95447 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LCA5LO95447 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LCA5LO95447 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LCA5LO95447 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LCA5LO95447 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LCA5LO95447 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LCA5LO95447 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LCA5LO95447 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LCA5LO95447 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LCA5LO95447 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LCA5LO95447 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LCA5LO95447 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LCA5LO95447 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LCA5LO95447 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LCA5LO95447 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LCA5LO95447 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LCA5LO95447 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LCA5LO95447 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LCA5LO95447 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LCA5LO95447 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LCA5LO95447 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LCA5LO95447 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LCA5LO95447 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LCA5LO95447 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LCA5LO95447 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LCA5LO95447 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LCA5LO95447 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LCA5LO95447 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LCA5LO95447 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LCA5LO95447 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LCA5LO95447 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LCA5LO95447 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LCA5LO95447 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LCA5LO95447 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms