Protein–RNA interactions for Protein: O75400

PRPF40A, Pre-mRNA-processing factor 40 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 957 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40AO75400 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
PRPF40AO75400 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PRPF40AO75400 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PRPF40AO75400 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
PRPF40AO75400 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.53■■■□□ 2
PRPF40AO75400 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PRPF40AO75400 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PRPF40AO75400 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PRPF40AO75400 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PRPF40AO75400 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.52■■■□□ 2
PRPF40AO75400 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
PRPF40AO75400 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
PRPF40AO75400 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PRPF40AO75400 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PRPF40AO75400 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
PRPF40AO75400 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PRPF40AO75400 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
PRPF40AO75400 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRPF40AO75400 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRPF40AO75400 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRPF40AO75400 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRPF40AO75400 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRPF40AO75400 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRPF40AO75400 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRPF40AO75400 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRPF40AO75400 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRPF40AO75400 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRPF40AO75400 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRPF40AO75400 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRPF40AO75400 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
PRPF40AO75400 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRPF40AO75400 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRPF40AO75400 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRPF40AO75400 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRPF40AO75400 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRPF40AO75400 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRPF40AO75400 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRPF40AO75400 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRPF40AO75400 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRPF40AO75400 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
PRPF40AO75400 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRPF40AO75400 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
PRPF40AO75400 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRPF40AO75400 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRPF40AO75400 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRPF40AO75400 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRPF40AO75400 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRPF40AO75400 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRPF40AO75400 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRPF40AO75400 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRPF40AO75400 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRPF40AO75400 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRPF40AO75400 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRPF40AO75400 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRPF40AO75400 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRPF40AO75400 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRPF40AO75400 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PRPF40AO75400 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PRPF40AO75400 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PRPF40AO75400 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
PRPF40AO75400 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PRPF40AO75400 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PRPF40AO75400 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PRPF40AO75400 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PRPF40AO75400 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PRPF40AO75400 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRPF40AO75400 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRPF40AO75400 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRPF40AO75400 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
PRPF40AO75400 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRPF40AO75400 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRPF40AO75400 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRPF40AO75400 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRPF40AO75400 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRPF40AO75400 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRPF40AO75400 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRPF40AO75400 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRPF40AO75400 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRPF40AO75400 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRPF40AO75400 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRPF40AO75400 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRPF40AO75400 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRPF40AO75400 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRPF40AO75400 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRPF40AO75400 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRPF40AO75400 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRPF40AO75400 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRPF40AO75400 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRPF40AO75400 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRPF40AO75400 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRPF40AO75400 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRPF40AO75400 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRPF40AO75400 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRPF40AO75400 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PRPF40AO75400 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PRPF40AO75400 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PRPF40AO75400 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PRPF40AO75400 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PRPF40AO75400 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PRPF40AO75400 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms